Navegando por Autor "Gomes, Ana Francisca Teixeira"
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Artigo Anti-obesity therapeutic targets studied in silico and in vivo: a systematic review(International Journal of Molecular Sciences, 2024-04) Maia, Juliana Kelly da Silva; Medeiros, Wendjilla Fortunato de; Gomes, Ana Francisca Teixeira; Aguiar, Ana Júlia Felipe Camelo; Queiroz, Jaluza Luana Carvalho de; Bezerra, Ingrid Wilza Leal; Piuvezam, Grasiela; Morais, Ana Heloneida de AraújoIn the age of information technology and the additional computational search tools and software available, this systematic review aimed to identify potential therapeutic targets for obesity, evaluated in silico and subsequently validated in vivo. The systematic review was initially guided by the research question “What therapeutic targets have been used in in silico analysis for the treatment of obesity?” and structured based on the acronym PECo (P, problem; E, exposure; Co, context). The systematic review protocol was formulated and registered in PROSPERO (CRD42022353808) in accordance with the Preferred Reporting Items Checklist for Systematic Review and Meta-Analysis Protocols (PRISMA-P), and the PRISMA was followed for the systematic review. The studies were selected according to the eligibility criteria, aligned with PECo, in the following databases: PubMed, ScienceDirect, Scopus, Web of Science, BVS, and EMBASE. The search strategy yielded 1142 articles, from which, based on the evaluation criteria, 12 were included in the systematic review. Only seven these articles allowed the identification of both in silico and in vivo reassessed therapeutic targets. Among these targets, five were exclusively experimental, one was exclusively theoretical, and one of the targets presented an experimental portion and a portion obtained by modeling. The predominant methodology used was molecular docking and the most studied target was Human Pancreatic Lipase (HPL) (n = 4). The lack of methodological details resulted in more than 50% of the papers being categorized with an “unclear risk of bias” across eight out of the eleven evaluated criteria. From the current systematic review, it seems evident that integrating in silico methodologies into studies of potential drug targets for the exploration of new therapeutic agents provides an important tool, given the ongoing challenges in controlling obesityArtigo Caracterização físico-química de inibidor de tripsina isolado de sementes de tamarindo (Tamarindus indica l.) Nanoencapsuladoem proteína do leite isolada(Brazilian Journal of health Review, 2019) Morais, Ana Heloneida de Araújo; Oliveira, Gerciane Silva de; Costa, Rafael Oliveira de Araújo; Pais, Tatiana dos Santos; Gomes, Ana Francisca Teixeira; Matias, Lídia Leonize Rodrigues; Medeiros, Amanda Fernandes de; Queiroz, Jaluza Luana Carvalho de; Passos, Thaís SouzaIntrodução: O inibidor de tripsina isolado de sementes de tamarindo (Tamarindus indica L.) (ITT) apresenta ação sacietogênica e anti-inflamatória em modelo experimental. Associado a isto, a encapsulação de proteínas bioativas atua promovendo uma melhora e prolongamento da ação destes ativos.Objetivo: Avaliar o nanoencapsulamento deste inibidor em proteína isolada do leite. Metodologia:O inibidor foi extraído das sementes de tamarindo e isolado por meio de cromatografia de afinidade em Tripsina-Sepharose. Posteriormente, foi encapsulado por meio da técnica de nanoprecipitação em solvente orgânico, na proporção ITT: proteína do soro do leite isolada de 1:4 (p/p). As partículas obtidas foram caracterizadas por diferentes métodos físico-químicos e, avaliadas quanto à eficiência de incorporação. Resultados:A micrografia do encapsulado mostrou a formação de nanopartículas esféricas (83.80 nm (5.80)) (figura 01), com tamanhos heterogêneos, corroborando com a difração laser (Índice de Polidispersão de 0.6 (0.080)), sem depressões e, de acordo com a análise de potencial zeta, instáveis e, com tendência a agregação. As análises de Espectroscopia por Transformada de Fourier (figura 2) e Difração de raios X (figura 3), mostraram, respectivamente, a presença de novas interações químicas entre o agente encapsulante e, o ITT, e natureza amorfa, fornecendo assim um indicativo da encapsulação, sendo este reforçado pelo alto percentual de incorporação do ITT (97.34 (5.50) %). Conclusão: A nanoencapsulação do ITT com proteína isolada do leite se mostra uma ferramenta inovadora, constituindo uma possível aplicação biotecnológica deste ativo, aumentando com isto o seu potencial de utilizaçãoArtigo Chitosan-whey protein nanoparticles improve encapsulation efficiency and stability of a trypsin inhibitor isolated from tamarindus indica L(Food Hydrocolloids, 2018-11) Maciel, Bruna Leal Lima; Queiroz, Jaluza Luana Carvalho de; Costa, Rafael Oliveira de Araújo; Matias, Lídia Leonize Rodrigues; Medeiros, Amanda Fernandes de; Gomes, Ana Francisca Teixeira; Pais, Tatiana dos Santos; Passos, Thais Souza; Santos, Elizeu Antunes dos; Morais, Ana Heloneida de AraújoStudies have shown that the trypsin inhibitor isolated from tamarind seeds (Tamarindus indica L.) (TTI) has satietogenic and anti-inflammatory actions in an experimental model. Aiming to increase the efficiency and stability of its antitriptic activity, the single and conjugated effect of chitosan and whey protein isolate on the incorporation, activity, and stability of TTI was investigated. The particles were obtained by nanoprecipitation technique, evaluated for the efficiency of incorporation and characterized by physical-chemical methods, determination of the amount of inhibitor that reduces the antitriptic activity in 50% (IC50) and, stability in different temperatures and pH. The combination of chitosan and whey protein isolate formed spherical nanoparticles (109 nm), promoted a reduction in IC50 (0.05 mg) compared to pure TTI (0.21 mg), and preserved the inhibitory activity up to 80 °C [35.0% (3.74)] compared to other formulations and TTI [0.0 (0.00)]. In addition, nanoparticles presented stability to the different pH conditions. Thus, the combination of encapsulating agents showed an important strategy to improve the function and stability of TTIDissertação Estudo in silico de alvos terapêuticos no tratamento do Diabetes Mellitus(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2023-03-31) Gomes, Ana Francisca Teixeira; Morais, Ana Heloneida de Araújo; Vale, Sancha Helena de Lima; https://orcid.org/0000-0002-0972-1678; http://lattes.cnpq.br/9918303712320354; ttps://orcid.org/0000-0002-6460-911X; http://lattes.cnpq.br/1233944493334651; https://orcid.org/0000-0003-1265-0089; http://lattes.cnpq.br/4189921173254097; Marinho, Emmanuel Silva; Cobucci, Ricardo Ney OliveiraO Diabetes Mellitus (DM) é um dos distúrbios metabólicos mais prevalentes no mundo, sendo crescente a busca por novos agentes terapêuticos como os peptídeos alimentares. Essa busca pode ser otimizada por meio de ferramentas da bioinformática. Dessa forma, o objetivo do presente estudo foi analisar os potenciais alvos terapêuticos para o controle glicêmico. Foi desenvolvida uma revisão sistemática (RS), seguindo as recomendações do Preferred Reporting Items Checklist for Systematic Review and Meta-Analysis (PRISMA), de acordo com o protocolo registrado no PROSPERO (CRD42022353808) e publicado. Foram incluídos estudos que atenderam a estratégia PECo (Problema, Exposição, Contexto). As bases de dados utilizadas foram: Medline (PubMed); Web of Science; Scopus; Embase; ScienceDirect; Biblioteca Virtual em Saúde (BVS). Foram identificados 1878 artigos, sendo incluídos 20 artigos referentes a estudos originais in silico que utilizaram alvos terapêuticos para o tratamento do DM e que validaram o uso desses alvos in vivo. O risco de viés foi avaliado por um checklist baseado no Strengthening the reporting of empirical simulation studies (STRESS). Foi observado que GLUT4, DPP-IV e PPARγ foram os alvos terapêuticos utilizados com mais frequência nos estudos incluídos na RS. Ainda por meio dos estudos in vivo, constatou-se a validação dos alvos terapêuticos mencionados anteriormente, além de Akt, GLP-1, α-amilase, GIP, IR, IRS1, IGF-1 e GSK-3, analisados in silico constatou-se a importância da simulação computacional como uma ferramenta útil no rastreamento e seleção prévia dos mesmos. Para o estudo in silico, o inibidor de tripsina de sementes de tamarindo (ITT) foi obtido por cromatografia de afinidade tripsina-sepharose 4B-CNBr e caracterizado por atividade antitríptica, quantificação proteica e gel SDS-PAGE. O ITT foi hidrolisado in vitro para monitoramento da susceptibilidade enzimática e seleção de enzimas para clivagem in silico, sendo utilizando o protocolo adaptado da INFOGEST, simulando as três fases da digestão e monitorado o padrão de hidrólise por gel SDS-PAGE. Com base nessas informações, o modelo teórico do inibidor de tripsina de sementes de tamarindo purificado (ITTp 56/287) foi clivado in silico, sendo selecionado para simulação por dinâmica molecular, o Peptideotripquimo59, por apresentar maior potencial de interação com o receptor de insulina (IR) (PDB ID 4OGA), apresentando docking score de -175,53. O Peptideotripquimo59 apresentou afinidade e estabilidade com o IR alcançado equilíbrio no início da simulação e aumentou a estabilidade quando adicionado ao complexo formado por insulina/IR, com comportamento sinérgico, considerando a EPI. Além disso, foram identificados os resíduos de aminoácidos Arginina16 (-209,07 kJ mol-1), Treonina1 (-148,54 kJ mol-1) e Valina2 (-94,53 kJ mol-1) como os que mais interagiram, sendo esse local de interação com o IR em região diferente comparado ao da insulina. Por meio da RS, percebeu-se a diversidade de alvos que podem ser utilizados para o tratamento do DM analisados in silico e validados in vivo, contribuindo para a descoberta de novos aliados para o tratamento do DM. Além disso, o Peptideotripquimo59 se mostrou uma molécula mimética a insulina, podendo atuar como um possível candidato para o tratamento do DM tipo 1 e 2.Artigo In silico structure-based designers of therapeutic targets for diabetes mellitus or obesity: a protocol for systematic review(Plos One, 2022) Morais, Ana Heloneida de Araújo; Gomes, Ana Francisca Teixeira; Medeiros, Wendjilla Fortunato de; Oliveira, Gerciane Silva de; Medeiros, Isaiane; Maia, Juliana Kelly da Silva; Bezerra, Ingrid Wilza Leal; Piuvezam, Grasiela; https://orcid.org/0000-0002-6460-911XObesity is a significant risk factor for several chronic non-communicable diseases, being closely related to Diabetes Mellitus. Computer modeling techniques favor the understanding of interaction mechanisms between specific targets and substances of interest, optimizing drug development. In this article, the protocol of two protocols of systematic reviews are described for identifying therapeutic targets and models for treating obesity or diabetes mellitus investi gated in silico. The protocol is by the guidelines from the Preferred Reporting Items for System atic Reviews and Meta-Analyzes Protocols (PRISMA-P) and was published in the International Prospective Register of Systematic Reviews database (PROSPERO: CRD42022353808). Search strategies will be developed based on the combination of descriptors and executed in the following databases: PubMed; ScienceDirect; Scopus; Web of Science; Virtual Health Library; EMBASE. Only original in silico studies with molecular dynamics, molecular docking, or both will be inserted. Two trained researchers will independently select the articles, extract the data, and assess the risk of bias. The quality will be assessed through an adapted version of the Strengthening the Reporting of Empirical Simulation Studies (STRESS) and the risk of bias using a checklist obtained from separate literature sources. The implementation of this protocol will result in the elaboration of two systematic reviews identifying the therapeutic tar gets for treating obesity (review 1) or diabetes mellitus (review 2) used in computer simulation studies and their models. The systematization of knowledge about these treatment targets and their in silico structures is fundamental, primarily because computer simulation contributes to more accurate planning of future either in vitro or in vivo studies. Therefore, the reviews devel oped from this protocol will guide decision-making regarding the choice of targets/models in future research focused on therapeutics of obesity or Diabetes Mellitus contributing to mitigate of factors such as costs, time, and necessity of in vitro and/or in vivo assaysArtigo Interaction between insulin receptor and a peptide derived from a trypsin inhibitor purified from tamarind seed: An in silico screening of insulin-like peptides(Arabian Journal of Chemistry, 2024-06) Vale, Sancha Helena de Lima; Gomes, Ana Francisca Teixeira; Medeiros, Wendjilla Fortunato de; Bezerra, Lucas Lima; Luz, Anna Beatriz Santana; Sousa Junior, Francisco Canindé de; Santos, Eliseu Antunes dos; Monteiro, Norberto de Kássio Vieira; Morais, Ana Heloneida de Araújo; https://orcid.org/0000-0002-0972-1678; https://orcid.org/0000-0002-5565-7101; https://orcid.org/0000-0003-2042-4348; https://orcid.org/0000-0002-6460-911XThe aim of this study was to prospect in silico peptides derived from a multifunctional protein and assess their interaction with the insulin receptor (IR). The trypsin inhibitor isolated from tamarind seeds (TTI) was obtained through trypsin sepharose 4B-CNBr affinity chromatography and subsequently characterized. The TTI underwent in vitro hydrolysis to assess its susceptibility to enzymatic degradation and determine suitable enzymes for cleavage in silico. The theoretical model was established to assess the purified tamarind seed trypsin inhibitor (TTIp 56/287) being cleaved in silico and selected for simulation by molecular dynamics. Among the peptides generated, Peptidetripquimo59 presented the most negative docking score (-175.53) with the IR, indicating strong affinity and stability in complex formation. Significant interaction with the IR was observed for key residues, including arginine 16 (-209.07 kJ mol-1), threonine 1 (-148.54 kJ mol-1), and valine 2 (-94.53 kJ mol1). Additionally, it was discovered that both insulin and Peptidetripquimo59 exhibit binding to the identical location on the insulin receptor (IR). The results of the semi-empirical approach revealed that Peptidetripquimo59 exhibited greater potential for interaction with the IR compared to other complexes such as the insulin-IR complex, suggesting its candidacy as a starting point for the development of therapeutic agents targeting both type 1 and type 2 Diabetes mellitusTCC Investigação do inibidor de tripsina de sementes de tamarindo (Tamarindus indica L.) como potencial agente terapêutico no Diabetes Mellitus: um estudo in silico sobre a interação com a α-amilase(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2024-06-03) Chaves, Rose de Paiva; Morais, Ana Heloneida de Araújo; Souza, Larissa Aída Lemos; http://lattes.cnpq.br/4242025866011009; https://orcid.org/0000-0002-6460-911X; http://lattes.cnpq.br/1233944493334651; http://lattes.cnpq.br/3084354365410183; Morais, Ana Heloneida de Araújo; https://orcid.org/0000-0002-6460-911X; http://lattes.cnpq.br/1233944493334651; Souza, Larissa Aída Lemos; http://lattes.cnpq.br/4242025866011009; Gomes, Ana Francisca Teixeira; https://orcid.org/0000-0003-1265-0089; http://lattes.cnpq.br/4189921173254097O inibidor de tripsina de semente de tamarindo (Tamarindus indica L.) (ITT) apresenta uma variedade de efeitos terapêuticos em estudos pré-clínicos, sendo a sua ação hipoglicemiante apresentada em alguns desses estudos. Contudo, ainda não se sabe se o ITT inibe enzimas envolvidas no processo de digestão de carboidratos, tal como a α-amilase. Neste estudo, objetivou-se avaliar a interação in silico entre as sequências aminoacídicas teóricas do ITT [modelo número 56, na conformação número 287 (ITTp 56/287)] e da α-amilase de porco (PDB ID 1DHK). Para isso, inicialmente foi realizado o alinhamento por meio do ClustalW2 entre a sequência do ITTp 56/287 e as três sequências de inibidores de α-amilase mais descritos na literatura RCSB PDB (PDB: Protein Data Bank). Em seguida, foram comparadas as sequências por similaridade e identificados os principais resíduos de aminoácidos conservados. Por fim, foi realizado o docking molecular para análise da predição de interação, por meio do servidor HDOCK. O maior percentual de identidade ocorreu entre o inibidor de α-amilase (ID 1AVA_2) e o ITTp 56/287, apresentando 29,94%. Quando alinhado o ITTp 56/287 ao inibidor de α-amilase de maior identidade, foram identificados resíduos de aminoácidos conservados, dentre eles a Tirosina (Y), a Lisina (K) e a Arginina (R), porém não estavam relacionados ao sítio ativo da enzima α-amilase. O docking molecular apresentou alto potencial de interação entre o ITTp 56/287 e a α-amilase (docking score -234.30; Confidence Score 0.8437; Ligand RMSD 53.98), sendo identificados 13 aminoácidos do ITTp 56/287 com menor ângulo de interação com a α-amilase, destacando-se, entre eles, a Serina (S), a Leucina (L), o Ácido Glutámico (E) e a R. Sugere-se, considerando os resultados in silico, que o ITTp possua potencial para inibir a α-amilase in vitro e que provavelmente apresente uma mecanística não competitiva por não interagir in silico com os resíduos do sítio ativo da α-amilase utilizada neste estudo. Contudo, serão necessários mais estudos para que essa nova hipótese seja confirmada.TCC Obtenção e caracterização de micropartículas de quitosana e proteína bioativa de tamarindo (Tamarindus Indica L.)(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2018-05) Gomes, Ana Francisca Teixeira; Morais, Ana Heloneida de Araújo; Jaluza Luana Carvalho de Queiroz; Morais, Ana Heloneida de Araújo; Queiroz, Jaluza Luana Carvalho de; Passos, Thais SouzaO encapsulamento é uma técnica muito utilizada na área farmacêutica, de cosméticos e de alimentos, possuindo como uma das finalidades, melhorar a estabilidade de substâncias bioativas ou nutrientes, prolongando a liberação no local alvo de atuação. Visando melhorar a eficiência da atividade anti-tríptica do inibidor de tripsina isolado de semente de tamarindo (ITT), um reconhecido inibidor com ação sacietogênica, o grupo de pesquisa em Nutrição e Substâncias Bioativas para Saúde vem avaliando alternativas, e dentre elas o encapsulamento dessa molécula. O objetivo do presente estudo foi encapsular o ITT em quitosana e caracterizar as partículas adquiridas. O ITT foi obtido por método de Cromatografia de afinidade Tripsina-Sepharose e a quitosana foi purificada para posterior obtenção das partículas por meio da técnica de precipitação em solvente orgânico, utilizando a quitosana como agente encapsulante. O encapsulado foi submetido à caracterização por MEV para determinação das particularidades da superfície das partículas, Difração a Laser que fornece informação sobre o tamanho obtido, Potencial Zeta que menciona a carga superficial da partícula, DRX que determina se a estrutura do material é cristalina ou amorfa e FTIR que especifica o tipo de ligações químicas presentes no material, além de ser avaliado quanto à eficiência de encapsulação e por se tratar de um inibidor de tripsina foi determinada a atividade antitríptica para estipular quando de inibidor foi protegido. O encapsulado de ITT em quitosana (EQ), não obteve formato definido e apresentou depressões na superfície. Foi observado um tamanho médio de 619 nm, sendo considerada como micropartícula e índice de polidispersão de 0,267 indicando uma distribuição homogênea de tamanho. Foi mostrado que o EQ obteve carga superficial positiva de 23,31 mV classificado como moderadamente estável. A quitosana purificada e o ITT demonstraram estrutura cristalina diferentemente do EQ que apresentou estrutura amorfa, indicando que houve interação entre agente encapsulante e substância ativa. Foram evidenciadas bandas deslocadas na mesma região do espectro da quitosana purificada, bandas atenuadas de ITT e surgimento de novas bandas após a encapsulação. Foi demonstrado atividade antitríptica de 99%, alcançando uma eficiência de encapsulação de 99%. A encapsulação do ITT em quitosana conseguiu manter a atividade antitríptica, apresentando assim uma ótima eficiência de encapsulação. Contudo, a estrutura formada não obteve tamanho em escala nano nem superfície íntegra, não oferecendo segurança quanto à proteção da substância encapsulada.TCC Variações no perfil lipídico em adultos e idosos de uma coorte na cidade de Natal/RN: o estudo BRAZUCA(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2025-06-17) Duarte, Kevia Maria; Reis, Bruna Zavarize; Santos, Ikson Rauan dos; 0009-0003-0090-2151; http://lattes.cnpq.br/0489390163869457; 0000-0001-8726-8699; http://lattes.cnpq.br/0683344477426879; 0009-0008-4834-508X; http://lattes.cnpq.br/9561649677251613; Gomes, Ana Francisca TeixeiraAlterações nos níveis de lipídios séricos, como o aumento dos triglicerídeos (TG), do colesterol total (CT) e do colesterol ligado à lipoproteína de baixa densidade (LDL-c), juntamente com a redução do colesterol ligado à lipoproteína de alta densidade (HDL-c) que contemplam o perfil lipídico, contribuem para o aumento do risco de desenvolvimento de Doenças Cardiovasculares (DCV), que seguem figurando entre os agravos crônicos mais letais e preveníveis da atualidade. Adicionalmente, modificações no estilo de vida e contexto social durante a pandemia do COVID-19 podem ter potencializado a incidência e a gravidade de desfechos cardiovasculares na população. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar as variações do perfil lipídico de adultos e idosos de uma coorte na cidade de Natal/RN no contexto pós-pandemia de COVID-19. Esse estudo trata-se de uma coorte prospectiva, vinculada ao estudo BRAZUCA/NATAL acompanhada em 2019 (fase 1) e 2023/2024 (fase 2). Foram coletados dados sociodemográficos, antropométricos e coleta de sangue para análise bioquímica de 50 participantes. Em seguida, foram comparadas as variações no perfil lipídico de acordo com a microrregião de moradia dos indivíduos. A mediana de idade dos participantes foi de 57 anos na Fase 1 e 61,5 na Fase 2, 66% era do sexo feminino e 52% declararam ser da cor parda. Durante o acompanhamento da coorte, houve um aumento de 18% na prevalência de hipertensão (p=0,004) e 14% para diabetes mellitus (p=0,016). Quanto ao tabagismo, o número de fumantes ativos foi pequeno e reduziu ao longo do tempo. Em relação ao perfil lipídico, foi observado um aumento significativo dos níveis de LDL-c entre os participantes residentes na Zona Sul de Natal (Δ = 10mg/dL; p=0,010) e aumento nos níveis de HDL-c entre aqueles da Zona Leste (Δ = 7,5 mg/dL; p= 0,034). Dessa forma, o estudo evidenciou variações importantes no perfil lipídico entre regiões de Natal/RN, associadas a fatores regionais e estilo de vida, especialmente no contexto pós-pandemia. Esses achados destacam a importância de estratégias regionais e intervenções nutricionais educativas e contínuas, culturalmente adaptadas, voltadas à prevenção e controle das DCV, contribuindo para a promoção da saúde coletiva no município.