Novos alvos moleculares para detecção de genotipagem de toxoplasma gondii
| dc.contributor.advisor | Lanza, Daniel Carlos Ferreira | |
| dc.contributor.advisorID | pt_BR | |
| dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/6851351991421755 | |
| dc.contributor.author | Costa, Maria Eduarda de Souza Menezes da | |
| dc.contributor.authorID | pt_BR | |
| dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/3023326726786878 | |
| dc.contributor.referees1 | Guedes, Paulo Marcos da Matta | |
| dc.contributor.referees1ID | pt_BR | |
| dc.contributor.referees1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5445410844075357 | |
| dc.contributor.referees2 | Moreira, Paula Viviane de Souza Queiroz | |
| dc.contributor.referees2ID | pt_BR | |
| dc.date.accessioned | 2016-09-06T23:03:43Z | |
| dc.date.available | 2016-09-06T23:03:43Z | |
| dc.date.issued | 2016-01-27 | |
| dc.description.resumo | O Toxoplasma gondii é um parasito mundialmente distribuído, que pode causar desde sintomas parecidos com a gripe até problemas neurológicos. As cepas do T. gondii apresentam grande variabilidade genética na América do Sul, sendo fundamental a análise de sequências para auxiliar no diagnóstico confiável e para classificação dos diferentes genótipos. O objetivo deste trabalho foi desenvolver dois métodos moleculares, um para detecção e o outro para genotipagem do T. gondii, possibilitando a identificação de todas as cepas conhecidas e a geração de dados que possam ser correlacionados com a virulência. Inicialmente, foi utilizado o programa MUSCLE para alinhamento de 685 sequencias nucleotídicas obtidas do GenBank, em seguida os alinhamentos foram analisados no programa MEGA 6.0 para determinação de sua variabilidade genética. O gene GRA7 foi selecionado como alvo para os iniciadores, que foram desenhados em regiões conservadas do gene utilizando os programas Geneious 9.0 e Primer BLAST. O protocolo de amplificação utilizando-se os primers para o gene GRA7 foi então comparado com outros protocolos padronizados para amplificação do gene B1 e do elemento repetitivo de 529 pb, que são os marcadores mais utilizados para o diagnóstico do T. gondii. Para o desenvolvimento do sistema de genotipagem foram selecionados os genes ROP5, ROP18 e GRA7, que estão relacionados ao mecanismo de virulência melhor descrito em T. gondii. O sistema de genotipagem desenvolvido se baseia na análise de polimorfismos presentes em fragmentos sob seleção positiva desses genes, que permite identificar cepas pertencentes as linhagens clonais e cepas atípicas. Utilizando-se essa nova abordagem para a seleção de marcadores, será necessário investigar um número de regiões do genoma consideravelmente menor que o utilizado pelo método utilizado tradicionalmente, simplificando o processo. Concluindo, o desenho de primers em regiões conservadas do gene GRA7 permitiu o desenvolvimento de um sistema de detecção utilizando PCR com excelente positividade e sensibilidade, principalmente para detecção de cepas atípicas do T. gondii. Ainda, a genotipagem baseada na detecção de polimorfismos em genes de virulência permitiu a diferenciação genotípica das diferentes cepas de forma mais simples que a técnica de RFLP utilizada atualmente. | pt_BR |
| dc.identifier.citation | COSTA, Maria Eduarda de Souza Menezes da. Novos alvos moleculares para detecção de genotipagem de toxoplasma gondii. 2016. 70f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária) - Centro de Biociências, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2016. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/21369 | |
| dc.language | por | pt_BR |
| dc.publisher | Universidade Federal do Rio Grande do Norte | pt_BR |
| dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
| dc.publisher.initials | UFRN | pt_BR |
| dc.publisher.program | PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOLOGIA PARASITÁRIA | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.subject | Toxoplasma gondii | pt_BR |
| dc.subject | Marcador molecular | pt_BR |
| dc.subject | Virulência | pt_BR |
| dc.subject | Cepa atípica | pt_BR |
| dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: BIOLOGIA PARASITÁRIA | pt_BR |
| dc.title | Novos alvos moleculares para detecção de genotipagem de toxoplasma gondii | pt_BR |
| dc.type | masterThesis | pt_BR |
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