Biofísica molecular: do transporte eletrônico em sistemas biológicos à descrição quântica da estabilidade do colágeno humano

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dc.contributor.advisorFulco, Umberto Laino
dc.contributor.advisor-co1Albuquerque, Eudenilson Lins de
dc.contributor.advisor-co1IDpt_BR
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3594651355252245
dc.contributor.advisorIDpt_BR
dc.contributor.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/9579151361576173
dc.contributor.authorOliveira, Jonas Ivan Nobre
dc.contributor.authorIDpt_BR
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/2461374517882321
dc.contributor.referees1Caetano, Ewerton Wagner Santos
dc.contributor.referees1IDpt_BR
dc.contributor.referees1Latteshttp://lattes.cnpq.br/6647492142392254
dc.contributor.referees2Corso, Gilberto
dc.contributor.referees2IDpt_BR
dc.contributor.referees2Latteshttp://lattes.cnpq.br/0274040885278760
dc.contributor.referees3Vieira, Vinícius Manzoni
dc.contributor.referees3IDpt_BR
dc.contributor.referees3Latteshttp://lattes.cnpq.br/7335017320399198
dc.date.accessioned2016-02-04T20:35:03Z
dc.date.available2016-02-04T20:35:03Z
dc.date.issued2015-02-26
dc.description.resumoEsta tese trata de duas pesquisas no campo da modelagem molecular, com diferentes naturezas conceituais, porém, baseadas em semelhantes princípios teóricos da física quântica e da química computacional. No primeiro estudo, com o intuito de esclarecer os aspectos estruturais e energéticos da estabilidade da tripla-hélice do colágeno humano, foram quantificadas as energias de interação entre os resíduos de aminoácidos que compõem o peptídeo homotrimérico T3-785, por intermédio de cálculos de Mecânica Quântica na luz da Teoria do Funcional da Densidade (DFT) e do método de Fracionamento Molecular com Capuzes Conjugados (MFCC). Assim, as forças de atração e repulsão de cada um dos 90 resíduos que compõem o sistema foram assinadas e as regiões com alta/baixa estabilidade identificadas e comparativamente analisadas. Os dados obtidos aprofundaram as discussões sobre a estabilidade conformacional do colágeno. Na segunda pesquisa, propriedades de transporte eletrônico de dois modelos biológicos foram exploradas. Nesse sentido, 27 miRNAs associados ao autismo e peptídeos formados pelas sequências (Thr-Ala)n e (Ala-Lys)n tiveram suas curvas de corrente-voltagem (I x V) calculadas. Os cálculos computacionais foram parcialmente executados pelo método quântico DFT e, fundamentalmente, dentro de um modelo tight-binding, em conjunto com a técnica de matriz de transferência. No caso dos miRNAs, os resultados sugerem que um tipo de biosensor pode ser desenvolvido para distinguir diferentes tipos de autismo. Já os peptídeos analisados, demonstraram-se como bons candidatos para a construção de um diodo molecular. Ambos os resultados podem fundamentar e estimular pesquisas experimentais com essas biomoléculas no campo da nanoeletrônica.pt_BR
dc.identifier.citationOLIVEIRA, Jonas Ivan Nobre. Biofísica molecular: do transporte eletrônico em sistemas biológicos à descrição quântica da estabilidade do colágeno humano. 2015. 145f. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Centro de Biociências, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2015.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/19764
dc.language.isoporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal do Rio Grande do Nortept_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.initialsUFRNpt_BR
dc.publisher.programPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOQUÍMICApt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectModelagem molecularpt_BR
dc.subjectColágenopt_BR
dc.subjectEnergias de interaçãopt_BR
dc.subjectTeoria do funcional da densidadept_BR
dc.subjectFracionamento molecular com capuzes conjugadospt_BR
dc.subjectmiRNApt_BR
dc.subjectDiodopt_BR
dc.subjectPropriedades do transporte eletrônicopt_BR
dc.subjectTécnica de matriz de transferênciapt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICApt_BR
dc.titleBiofísica molecular: do transporte eletrônico em sistemas biológicos à descrição quântica da estabilidade do colágeno humanopt_BR
dc.title.alternativeMolecular biophysics: from electronic transport in biological systems to the quantum description of the human collegen stabilitypt_BR
dc.typedoctoralThesispt_BR

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