Navegando por Autor "Pinheiro, Daniele Maria Lopes"
Agora exibindo 1 - 4 de 4
- Resultados por página
- Opções de Ordenação
Dissertação Análise dos polimorfismos Arg194Trp e Arg399Gln no gene de reparo de DNA XRCC1 em pacientes com meningite bacteriana(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2012-09-28) Pinheiro, Daniele Maria Lopes; Lima, Lucymara Fassarella Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/5225954788648294; Rabenhorst, Silvia Helena Barem; ; http://lattes.cnpq.br/3868264006150535; Luchessi, André Ducati; ; http://lattes.cnpq.br/4420863418928278A meningite é uma doença infecto-contagiosa, na qual foi visto que características genéticas estão envolvidas na susceptibilidade à doença e na resposta inflamatória e isso pode ser determinado por polimorfismos de um único nucleotídeo (SNPs). As espécies reativas de oxigênio (ERO) participam do rompimento da barreira hematoencefálica (BHE), contribuindo dessa maneira para a entrada do patógeno no sistema nervoso central (SNC), na qual induz uma resposta inflamatória, a qual tem sido associada à morte neuronal e surgimento de sequelas nos pacientes que sobrevivem à doença. A via de reparo por excisão de bases (BER) é a principal via envolvida na correção de danos oxidados no DNA em neurônios e tem sido implicada na resposta a meningite bacteriana (MB). Neste trabalho foram avaliados dois SNPs não sinônimos do gene de reparo XRCC1 Arg194Trp (rs 1799782) e Arg399Gln (rs 25487) em pacientes com MB e pacientes não infectados (Controle). Os genótipos dos pacientes foram investigados pela PCR-RFLP. Os danos no DNA genômico foram detectados pelo tratamento com a glicosilase formamidopirimidina (FPG). As imunoglobulinas IgG e IgA foram analisadas através do plasma e as quimio/citocinas foram quantificadas em amostras do líquido cefalorraquidiano. Não foi encontrada nenhuma relação com a doença para o polimorfismo em XRCC1 Arg194Trp, no entanto para o polimorfismo XRCC1 Arg399Gln, foi observado um aumento na frequência do alelo variante no grupo controle em relação ao grupo de pacientes com MB (P = 0,008; OR=0,45). Não foi observada nenhuma alteração nos níveis de quimio/citocinas e imunoglobulinas, como também dos danos ao DNA dos pacientes com o alelo variante em relação aos pacientes com o alelo selvagem para o SNP XRCC1 Arg399Gln. Em conclusão, foi visto que apenas o SNP em XRCC1 Arg399Gln pode apresentar um possível efeito protetor em relação à doença.Artigo Chemical inhibition of Apurinic-apyrimidinic endonuclease 1 Redox and DNA repair functions affects the inflammatory response via different but overlapping mechanisms(Frontiers, 2021) Oliveira, Thais Teixeira; Fontes-Dantas, Fabrícia Lima; Oliveira, Rayssa Karla de Medeiros; Pinheiro, Daniele Maria Lopes; Coutinho, Leonam Gomes; Silva, Vandeclecio Lira da; Souza, Sandro José de; Agnez-Lima, Lucymara FassarellaThe presence of oxidized DNA lesions, such as 7,8-dihydro-8-oxoguanine (8-oxoG) and apurinic/apyrimidinic sites (AP sites), has been described as epigenetic signals that are involved in gene expression control. In mammals, Apurinic-apyrimidinic endonuclease 1/Redox factor-1 (APE1/Ref-1) is the main AP endonuclease of the base excision repair (BER) pathway and is involved in active demethylation processes. In addition, APE1/Ref-1, through its redox function, regulates several transcriptional factors. However, the transcriptional control targets of each APE1 function are not completely known. In this study, a transcriptomic approach was used to investigate the effects of chemical inhibition of APE1/Ref-1 redox or DNA repair functions by E3330 or methoxyamine (MX) in an inflammatory cellular model. Under lipopolysaccharide (LPS) stimulation, both E3330 and MX reduced the expression of some cytokines and chemokines. Interestingly, E3330 treatment reduced cell viability after 48 h of the treatment. Genes related to inflammatory response and mitochondrial processes were downregulated in both treatments. In the E3330 treatment, RNA processing and ribosome biogenesis genes were downregulated, while they were upregulated in the MX treatment. Furthermore, in the E3330 treatment, the cellular stress response was the main upregulated process, while the cellular macromolecule metabolic process was observed in MX-upregulated genes. Nuclear respiratory factor 1 (NRF1) was predicted to be a master regulator of the downregulated genes in both treatments, while the ETS transcription factor ELK1 (ELK1) was predicted to be a master regulator only for E3330 treatment. Decreased expression of ELK1 and its target genes and a reduced 28S/18S ratio were observed, suggesting impaired rRNA processing. In addition, both redox and repair functions can affect the expression of NRF1 and GABPA target genes. The master regulators predicted for upregulated genes were YY1 and FLI1 for the E3330 and MX treatments, respectively. In summary, the chemical inhibition of APE1/Ref-1 affects gene expression regulated mainly by transcriptional factors of the ETS family, showing partial overlap of APE1 redox and DNA repair functions, suggesting that these activities are not entirely independent. This work provides a new perspective on the interaction between APE1 redox and DNA repair activity in inflammatory response modulation and transcriptionTese Efeito do Resveratrol frente à resposta inflamatória no modelo celular U937(2018-11-09) Pinheiro, Daniele Maria Lopes; Lima, Lucymara Fassarella Agnez; ; ; Uchoa, Adriana Ferreira; ; Dalmolin, Rodrigo Juliani Siqueira; ; Santos, André Quincozes dos; ; Clemente, Tatjana Keesen de Souza Lima;O quadro denominado de estresse oxidativo parece ser um gatilho para o desenvolvimento de inúmeras patologias. Nesse cenário, a resposta inflamatória pode tornar-se um vilão para a homeostase, colocando em risco importantes vias de sinalização celular e nuclear. Frente a isso, o esforço em diminuir as sequelas de vias metabólicas disfuncionais tem ganhado força. Atualmente, muitos estudos têm proposto o uso de polifenois para reduzir uma resposta inflamatória exacerbada. O Resveratrol é um potente alvo por apresentar atividade antioxidante e funções biológicas importantes, sendo conhecido por exercer atividades cardioprotera, anticâncer, anti-inflamatória, neuroprotetora, entre outras. Nesse contexto, a fim de melhor elucidar como este antioxidante regula a inflamação, e revelar o perfil de transcrição gênica durante a resposta inflamatória em células expostas ao Resveratrol, foi utilizado o modelo celular de monócitos - U937. As células foram estimuladas com LPS por 24 h e co-incubadas com Resveratrol (15 μM) durante 4 h. Nossos resultados mostraram através de ensaios in vitro de viabilidade celular e apoptose, que o polifenol estudado não alterou a viabilidade celular como também não induziu morte celular programada. Através do sequenciamento do RNA mensageiro pela plataforma 454 foi revelado 8.671 genes diferencialmente expressos, sendo analisados os de fold change ≥2.0 e ≤-2.0. Os genes up regulados foram principalmente associados à transcrição, processos metabólicos, sistema imunológico e ciclo celular, enquanto que os genes down regulados estiveram associados aos processos de resposta inflamatória, transcrição e remodelação da cromatina. Comparando os dados do transcriptoma com as análises in vitro por imunoprecipitação e expressão proteica, observamos que o Resveratrol foi capaz de modular características epigenéticas como acetilação e metilação de histonas e não histonas. Pela primeira vez foi observada uma diminuição no padrão de acetilação de APE1/Ref-1 sem afetar a sua atividade de reparo. Em resumo, este estudo elucidou importantes processos biológicos relacionados ao efeito anti-inflamatório do Resveratrol, mostrando que o mesmo atua na regulação transcricional de genes relacionados a inflamação.Artigo Resveratrol decreases the expression of genes involved in inflammation through transcriptional regulation(2018-10-24) Pinheiro, Daniele Maria Lopes; Oliveira, Ana Helena Sales de; Coutinho, Leonam Gomes; Fontes, Fabrícia Lima; Oliveira, Rayssa Karla de Medeiros; Oliveira, Thais Teixeira; Faustino, André Luís Fonseca; Silva, Vandeclécio Lira da; Campos, Julliane Tamara Araújo de Melo; Lajus, Tirzah Braz Petta; Souza, Sandro José de; Agnez-Lima, Lucymara FassarellaOxidative stress generated during inflammation is associated with a wide range of pathologies. Resveratrol (RESV) displays anti-inflammatory and antioxidant activities, being a candidate for the development of adjuvant therapies for several inflammatory diseases. Despite this potential, the cellular responses induced by RESV are not well known. In this work, transcriptomic analysis was performed following lipopolysaccharide (LPS) stimulation of monocyte cultures in the presence of RESV. Induction of an inflammatory response was observed after LPS treatment and the addition of RESV led to decreases in expression of the inflammatory mediators, tumor necrosis factor-alpha (TNF-α), interleukin-8 (IL-8), and monocyte chemoattractant protein-1 (MCP-1), without cytotoxicity. RNA sequencing revealed 823 upregulated and 2098 downregulated genes (cutoff ≥2.0 or ≤−2.0) after RESV treatment. Gene ontology analysis showed that the upregulated genes were associated with metabolic processes and the cell cycle, consistent with normal cell growth and differentiation under an inflammatory stimulus. The downregulated genes were associated with inflammatory responses, gene expression, and protein modification. The prediction of master regulators using the iRegulon tool showed nuclear respiratory factor 1 (NRF1) and GA-binding protein alpha subunit (GABPA) as the main regulators of the downregulated genes. Using immunoprecipitation and protein expression assays, we observed that RESV was able to decrease protein acetylation patterns, such as acetylated apurinic/apyrimidinic endonuclease-1/reduction-oxidation factor 1 (APE1/Ref-1), and increase histone methylation. In addition, reductions in p65 (nuclear factor-kappa B (NF-κB) subunit) and lysine-specific histone demethylase-1 (LSD1) expression were observed. In conclusion, our data indicate that treatment with RESV caused significant changes in protein acetylation and methylation patterns, suggesting the induction of deacetylase and reduction of demethylase activities that mainly affect regulatory cascades mediated by NF-кB and Janus kinase/signal transducers and activators of transcription (JAK/STAT) signaling. NRF1 and GABPA seem to be the main regulators of the transcriptional profile observed after RESV treatment.