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TCC Análise da relação dos casos de dengue em Natal-RN, com o esgotamento sanitário e outras variáveis, no período entre 2013-2021(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2022-02-11) Brito, Leonardo Barbosa de; Araújo, Josélio Maria Galvão de; https://orcid.org/0000-0003-3548-2786; http://lattes.cnpq.br/6430774978643765; http://lattes.cnpq.br/0516496451282625; Holanda, Cecília Maria de Carvalho Xavier; http://lattes.cnpq.br/1864944034471719; Oliveira, Claudio Bruno Silva de; https://orcid.org/0000-0003-3957-7678; http://lattes.cnpq.br/9938199441264328A dengue é uma doença viral presente na maioria dos países tropicais e subtropicais. No Brasil, a dengue se destaca por apresentar-se de forma sazonal pelas características climáticas, onde se estabelecem períodos úmidos e quentes grande parte do ano. Em Natal-RN, os primeiros casos de dengue notificados foram no ano de 1996, e desde então vem se destacando como uma doença prevalente no município. O objetivo principal desse estudo é demonstrar um panorama global dos impactos da dengue no município de Natal e suas respectivas zonas administrativas (zona Sul, Norte, Leste e Oeste), associando esses casos à prevalência de esgotamento sanitário, e de forma mais geral, a outras variáveis sociais pertinentes ao tema. Foram analisados os anos de 2013 a 2021, com um total de 59.296 casos notificados de dengue em residentes do município. O ano de maior incidência foi 2019 (16.144) e o de menor incidência o ano de 2021 (1.048). Por suas características sazonais, alguns autores relacionam o número de casos com fenômenos climáticos como o El Niño. Relação que não se reproduz de acordo com os dados de precipitação pluviométrica para Natal. Observou-se também que a propagação de casos direcionados a áreas com maior vulnerabilidade social e a relação destes com os serviços de esgotamento sanitário ofertados à população, é um fator que deve ser levado em consideração. Foi importante, ainda, observar a associação entre casos de dengue e renda per capita de acordo com a zona administrativa da cidade. Vale salientar que outra variável importante para essa análise foi a escassez de dados, muitas vezes presente durante o estudo, limitando os resultados. É importante compreender que deve existir sempre um estado de alerta em relação à situação epidemiológica do Vírus Dengue no país, mesmo que ela se apresente de forma controlada e definida temporariamente em alguns casos, pois isso se torna importante do ponto de vista a se compreender a introdução ou a recirculação do vírus.Dissertação Análise in silico da interação do fármaco toremifeno com o complexo glicoproteico GP1/GP2 do vírus ebola(2019-02-15) Rocha, Jaerdyson Medeiros da; Oliveira, Jonas Ivan Nobre; ; ; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; Oliveira, Claudio Bruno Silva de;A Doença pelo Vírus Ebola (DVE) é responsável por surtos fatais de infecção, marcadamente pelos casos de epidemia no oeste da África. Segundo a OMS – Organização Mundial da Saúde, o surto de Ebola de 2014 produziu mais mortes que todos os surtos de ebola anteriores em conjunto. O envelope desse vírus é estruturalmente constituído por trímeros de uma glicoproteína (GP), que é clivada por furinas para formação das subunidades GP1 e GP2. Estas estão relacionadas à ancoragem e a fusão do vírus na célula do hospedeiro, respectivamente. A região FL (Fusion Loop region), contida na subunidade GP2, também chamada de “laço de fusão”, comporta-se como sítio de ligação KZ52 de um potente inibidor, o Toremifeno. Esse ligante age primordialmente como um antagonista de receptores de estrogênio durante ciclos de reposição hormonal, contudo estudos recentes demostraram uma forte e efetiva ligação com a glicoproteína do vírus Ebola. De fato, ensaios concisos de deslocamento térmico apontam que o Toremifeno quando ligado causa desestabilização de GP e desencadeia prematuramente a ativação de GP2, dessa forma impedindo a fusão entre o vírus e o endossoma do hospedeiro. Nessa dissertação, técnicas de Modelagem Molecular, especialmente o Método de Fracionamento Molecular com Capas Conjugadas (MFCC), foi utilizado no cálculo das energias de ligação entre os resíduos de aminoácidos da glicoproteína GP do vírus Ebola e o fármaco Toremifeno, no intuito de caracterizar energeticamente a afinidade a formação desse biocomplexo. A compreensão estrutural e energética do complexo toremifeno-GP1/GP2 revelará o mecanismo inibitório desse ligante e, subsequentemente, guiará o desenvolvimento de drogas antiEbola, até então inexistentes. Como resultados, [i] os resíduos ASP522 (-10,39 Kcal/mol), GLU100 (-8,59 Kcal/mol), TYR517 (-6,50 Kcal/mol), THR519 (-3,24 Kcal/mol), LEU186 (-2,77 Kcal/mol) e LEU515 (-2,76 Kcal/mol) são os principais responsáveis pela estabilidade do complexoToremifeno/GP1-GP2 do vírus Ebola; [ii]a ordem de relevância interacional das regiões do fármaco é i (e4: -63,02 kcal/mol; e40: -26,39) >iii (e4: -23,66 kcal/mol; e40: -21,11 Kcal/mol)> ii(e4: -10,36 kcal/mol; e40: -10,13 Kcal/mol); [iii]em termos de contribuição energética das estruturas secundárias do receptor GP1/GP2, a folha β-11 (GP1) e a folha β-18 (GP2), são as que possuem mais aminoácidos permissíveis ao acoplamento do ligante, já a folha β-10 (GP1) e a hélice α-18 (GP2)possuem os resíduos que causam repulsão do ligante ao bolsão de acoplagem.Dissertação Avaliação das atividades anti-toxoplásmica, antioxidante e antiinflamatória dos monoterpenos timol (lippia sidoides) e estragol (croton zenhtneri)(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2012-03-14) Oliveira, Claudio Bruno Silva de; Andrade Neto, Valter Ferreira de; ; http://lattes.cnpq.br/4863082845974813; ; http://lattes.cnpq.br/9938199441264328; Romero, Oscar Bruna; ; http://lattes.cnpq.br/2472508053117517; Rachetti, Vanessa de Paula Soares; ; http://lattes.cnpq.br/1524215726056886A toxoplasmose, doença de curso benigno em pacientes imunocompetentes, mas que pode ocasionar graves acometimentos clínicos em imunossuprimidos e gestantes é causada pelo Toxoplasma gondii (Tg), protozoário intracelular obrigatório. O arsenal profilático e terapêutico contra este parasito é bastante restrito, tornando urgente a busca por novos medicamentos. Uma alternativa promissora é a abordagem racional a partir de plantas medicinais. Neste estudo foram padronizadas metodologias objetivando avaliar os efeitos toxicológicos, antiproliferativos, antiinflamatórios, antioxidantes e anti-toxoplásmicos do Timol e Estragol isolados, respectivamente, das espécies vegetais Lippia sidoides e Croton zenhtneri, usadas popularmente na região do Cariri/CE para diversas moléstias. Inicialmente foram realizados testes de toxicidade in vivo e análise patológica do fígado dos camundongos. Avaliou-se a atividade antiinflamatória in vivo pelo método da bolsa de ar e pela medida da variação do edema de pata. Ensaios de citotoxicidade in vitro foram realizados, bem como pesquisas de atividade antiproliferativa, antioxidante e produção de óxido nítrico. A atividade anti-toxoplásmica foi avaliada em modelo murino de infecção não congênita (usando Tg ME-49 e Tg RH) e congênita, com períodos variados de infecção materna (Tg ME-49). Os resultados sugerem toxicidade baixa a moderada para os dois compostos. O Timol se mostrou mais tóxico, in vivo e in vitro, e teve maior repercussão patológica do que o Estragol. Os compostos foram inativos para atividade antiproliferativa. O Timol apresentou ótima atividade antioxidante enquanto o Estragol estimulou a produção de óxido nítrico em macrófagos. Ambos apresentaram significativa atividade antiinflamatória. Os dois compostos foram ativos apenas contra a cepa ME-49. No modelo de infecção congênita o Estragol proporcionou um aumento significativo de peso neonatal em filhotes de mães infectadas quando comparadas com o controle não tratado. O mesmo ocorreu com filhotes de mães tratadas, via subcutânea, com ambos os compostos após 30 dias. Conclui-se que o Timol e o Estragol possuem importantes atividades biológicas e anti-toxoplásmica. Estudos posteriores são necessários para elucidar o mecanismo de ação destes compostos, além de outras possíveis atividades não investigadas neste estudoTCC Candida krusei: aspectos atuais sobre epidemiologia, fatores de virulência e resistência antifúngica(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2022-12-02) Souza, Misma Kilvia Frazão de; Chaves, Guilherme Maranhão; http://lattes.cnpq.br/1463249528959656; http://lattes.cnpq.br/8160695188644251; Machado, Paula Renata Lima; http://lattes.cnpq.br/8904316209025915; Oliveira, Claudio Bruno Silva de; http://lattes.cnpq.br/9938199441264328A Candidíase é o termo utilizado para se referir a diversas infecções causadas por espécies do gênero Candida. Dentre as espécies de Candida causadoras de infecções oportunistas, Candida krusei é uma das espécies que vem ganhando destaque no cenário clínico de infecções oportunistas causadas por leveduras, pelo fato de ser intrinsecamente resistente ao fluconazol e por apresentar baixa susceptibilidade a outras classes de antifúngicos comumente utilizados, como anfotericina B, fluocitocina e as equinocandinas. É comumente isolada de infecções em pacientes que relatam terapia prévia com fluconazol, imunocomprometidos e aqueles com neoplasias hematológicas, predispostos a desenvolverem infecções superficiais e invasivas por C. krusei. Sendo assim, esta revisão de literatura tem como finalidade descrever os aspectos biológicos atuais, bem como analisar os fatores que predispõem as infecções causadas por C. krusei, além da expressão de fatores virulência, dos mecanismos envolvidos na resistência aos antifúngicos e a importância da rápida identificação desta espécie, o que pode favorecer o tratamento antifúngico eficaz precoce.Artigo Frequência e perfil de resistência de Klebsiella spp. em um hospital universitário de Natal/RN durante 10 anos(Jornal Brasileiro de Patologia e Medicina Laboratorial, 2011-12) Oliveira, Claudio Bruno Silva de; Dantas, Valéria Cristina Ribeiro; Neto, Renato Motta; Azevedo, Paulo Roberto Medeiros de; Melo, Maria Celeste Nunes deIntrodução: As espécies de Klebsiella spp. podem causar vários tipos de infecções, principalmente hospitalares, e têm merecido destaque pelos seus variados e emergentes mecanismos de resistência. Objetivos: Determinar a frequência de isolamento e a caracterização do perfil de resistência de Klebsiella spp. em um hospital universitário durante um período de 10 anos e, ainda, avaliar a tendência para o crescimento dessa resistência. Material e método: Fez-se um estudo descritivo e retrospectivo a partir de dados coletados nos livros de registro do Laboratório de Microbiologia Clínica do hospital investigado, correspondentes ao período de janeiro de 1999 a dezembro de 2008. Resultado: A frequência de isolamento de Klebsiella spp. foi de 13,4% com predominância em uroculturas (56,4%). Houve aumento significativo na resistência para a maioria dos antimicrobianos testados ao longo do período analisado com tendência para o crescimento da mesma. Nesse período, isolou-se 23% de Klebsiella spp. com fenótipo produtor de betalactamases de amplo espectro (ESBL). Discussão: O isolamento de Klebsiella spp. resistente a antimicrobianos em amostras de origem clínica e a detecção da tendência do crescimento da resistência, inclusive às drogas de reserva terapêutica, são motivos de grande preocupação. Nesse hospital, a implantação de métodos de triagem e de confirmatórios para os mecanismos de resistência de Klebsiella spp. poderiam auxiliar no diagnóstico e no tratamento das infecções causadas por esse microrganismo. Conclusão: A tendência de crescimento na resistência aos antibióticos detectada neste estudo reforça a importância de monitoramentos contínuos. Estes elucidam características locais, orientando para melhores medidas de controle.TCC Identification of Promiscuous T cell Epitopes on Mayaro virus structural proteins using immunoinformatics, molecular modeling, and QM:MM approaches(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2021-03-10) Silva, Maria Karolaynne; Oliveira, Jonas Ivan Nobre; Oliveira, Jonas Ivan Nobre; Oliveira, Claudio Bruno Silva de; Bezerra, Katyanna SalesThe Mayaro virus (MAYV) belongs to genus Alphavirus (family Togaviridae) and has been reported in several countries, especially in tropical regions of America. Due to its outbreaks and potential lack of medication, an effective vaccine formulation is strongly required. This study aimed to predict promiscuous T cell epitopes from structural polyproteins of MAYV using an immunoinformatics approach. For this purpose, consensus sequences were used to identify short protein sequences capable of binding to MHC class I and class II alleles. Our analysis pointed out 4 MHC-I/TCD8+ and 21 MHC-II/TCD4+ epitopes on capside (1;3), E1 (2;5), E2 (1;10), E3 (0;2), and 6K (0;1) proteins. These predicted epitopes were characterized by high antigenicity, immunogenicity, conservancy, non-allergenic, non-toxic, and good population coverage rate values for North and South American geographical areas. Afterwards, we used the crystal structure of human toll-like receptor 3 (TLR3) ectodomain as a template to predict, through docking essays, the placement of a vaccine prototype at the TLR3 receptor binding site. Finally, classical and quantum mechanics/molecular mechanics (QM:MM) computations were employed to improve the quality of docking calculations, with the QM part of the simulations being accomplished by using the density functional theory (DFT) formalism. These results provide important insights into the advancement of diagnostic platforms, the development of vaccines, and immunotherapeutic interventions.Dissertação Modelagem molecular da biodegradação do corante vermelho congo por lacases(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2022-07-27) Gomes, Heloísa Silva Saraiva; Oliveira, Jonas Ivan Nobre; Fulco, Umberto Laino; https://orcid.org/0000-0002-4528-9878; http://lattes.cnpq.br/9579151361576173; https://orcid.org/0000-0003-1646-921X; http://lattes.cnpq.br/2461374517882321; Silva Júnior, Edilson Dantas da; https://orcid.org/0000-0001-5505-8056; http://lattes.cnpq.br/5459705151588106; Oliveira, Claudio Bruno Silva deO aumento global da urbanização e da atividade industrial levou àproduçãoeincorporação de moléculas contaminantes aos ecossistemas. Emespecial, apoluição dos corpos hídricos por efluentes sem tratamento prévio causainúmerosdanos às espécies que vivem em ambientes aquáticos. Processos biotecnológicoseestratégias físicas, químicas e biológicas têm sido adotadas para eliminar essescontaminantes dos corpos d'água sob estresse antropogênico. Na perspectivadabiorremediação, as lacases são enzimas capazes de degradar compostosfenólicos,aromáticos e não aromáticos, inclusive corantes sintéticos produzidos noâmbitodaindústria têxtil. Nesse contexto, o presente trabalho se propõeaanalisarqualitativamente (tipo de ligação química), quantitativamente (energia deinteração)ede forma comparada os contatos intermoleculares do corante vermelhoCongoacoplado às lacases de Tratametes versicolor (CR-LacTv) e Pycnoporus sanguineus(CR-LacPs), inclusive identificando padrões de interação. Para a descriçãodasenergias de ligação individuais do tipo ligante-receptor existentesnessesbiocomplexos, utilizamos o esquema de fracionamento molecular comcapasconjugadas (MFCC) no escopo da Teoria do Funcional da Densidade(DFT). Osresultados apontam para uma maior afinidade do corante vermelho Congocomalacase de Pycnoporus sanguineus. No caso, o corante interage comLacPs(LacTv)com uma energia de ligação de -38,26 kcal/mol (-19,26 kcal/mol), com63,3%(63,6%)dos contatos intermoleculares com os aminoácidos do receptor ocorrendoapartirdaregião iii (i) desse ligante. Os principais resíduos do complexo CR-LacPs (CR-LacTv)são a ARG161, PHE162, GLY392, GNL160, SER393, PRO391, PHE265eGLY266(PHE162, ALA161, GLY266, ALA393, PHE 265, PRO391, PRO160, GLY392), nosquais destacamos a existência de seis (cinco) importantes ligações dehidrogênioedois (três) contatos hidrofóbicos em CR-LACPs (LacTv). A descriçãoestrutural eenergética das interações dos biocomplexos em questão auxilia no entendimentodasdiferenças em termos de estabilidade e eficácia de enzimas da mesmafamília,porém organismos distintos. Consequentemente, possibilitará estudos deaumentoda efetividade da biorremediação promovida por tais enzimas após alteraçõespontuais dirigidas.