Navegando por Autor "Motta Neto, Clóvis Coutinho da"
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Tese Aspectos cariogenômicos em espécies marinhas de Haemulidae (Perciformes) e Labridae (Labriformes): uma perspectiva evolutiva(2017-09-29) Motta Neto, Clóvis Coutinho da; Molina, Wagner Franco; Artoni, Roberto Ferreira; ; ; ; Souza, Allyson Santos de; ; Garcia Júnior, José; ; Cioffi, Marcelo de Bello; ; Lima Filho, Paulo Augusto de;A Série Percomorpha é maior divisão entre os vertebrados, constituindo o maior e mais derivado clado de peixes teleósteos. Dentre suas Ordens, Perciformes e Labriformes constituem modelos adequados à investigação do conservadorismo e diversificação cromossômica. Em Perciformes o conservadorismo cromossômico é representado por cariótipos basais com 2n=48 acrocêntricos, extensivamente compartilhados por uma parcela considerável de espécies. As causas e extensão do conservadorismo cariotípico em várias famílias desta Ordem não são inteiramente claras. Diante da diversidade de espécies em Labriformes, aspectos mais detalhados de sua evolução cariotípica ou mesmo status taxonômico de algumas espécies merecem particular atenção. Com vistas a contribuir com novas informações sobre essas questões foram implementadas análises cromossômicas convencionais (coloração convencional com Giemsa, bandamento C e Ag-RONs, fluocrocromos base-específicos) e citomoleculares (hibridização in situ com sondas DNAr 18S, DNAr 5S). Oito espécies dos gêneros Anisotremus e Haemulon da família Haemulidae (Perciformes) foram analisadas, incluindo amostras de diferentes áreas do Atlântico, como modelo de evolução conservativa. Em 2 espécies do gênero Bodianus da família Labridae (Labriformes), foram analisados também aspectos da evolução de sequências repetitivas particulares (DNAr 18S, DNAr 5S, Alu e Tol2) nos cromossomos por hibridização com 5 metilcitosina (5mC). Adicionalmente, foram realizadas comparações filogenéticas, utilizando sequências de DNA mitocondrial (COI e 16S) e nuclear (Rodopsina) para verificar o status taxonômico da espécie Bodianus insularis, endêmica das ilhas Meso-Atlânticas. Todas as espécies de Haemulidae apresentaram 2n=48a, sítios Ag-RONs simples e heterocromatina centromérica reduzida, além de considerável compartilhamento de sítios de DNAr 5S e 18S, confirmando a ocorrência de estase cariotípica na família. Os padrões cariotípicos das populações de A. virginicus e H. chrysargyreum entre o Caribe e Atlântico Sul não revelaram variações cromossômicas decorrentes da barreira dos deságues dos rios Amazonas/Orinoco. Em Bodianus, as análises identificaram uma notável região descondensada em um par cromossômico subtelocêntrico, denominada região BOD. Entre suas características constitutivas e funcionais particulares, se mostram DAPI-, argentofílica (Ag+), marcantemente hipometilada e saturada de elementos transponíveis, sugerindo que a participação destes elementos móveis pode ter contribuído para sua gênese e dinâmica epigenética complexa. Quanto a espécie endêmica B. insularis, sua divergência genética é muito inferior à apresentada por espécies diferenciadas sugerindo que embora represente um grupo geograficamente isolado, constitua uma sinonímia de B. pulchellus. A divergência nos ritmos de diversificação cariotípica entre Haemulidae e Labridae é aqui discutida à luz de características cariotípicas intrínsecas que podem favorecer o tamponamento e a fixação de mudanças cromossômicas e aspectos biológicos das espécies que contribuem para as condições particulares de evolução cariotípica desses dois grupos de peixes marinhos.Dissertação Contrastes da evolução cromossômica e diversificação do DNA repetitivo em peixes-anjos (pomacanthidae, teleostei)(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2021-10-11) Romeiro, Dalvan Henrique Luiz; Molina, Wagner Franco; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; http://lattes.cnpq.br/1002445114853312; Motta Neto, Clóvis Coutinho da; http://lattes.cnpq.br/8790601797102483; Costa, Gideão Wagner Werneck Felix da; http://lattes.cnpq.br/8974329991208250Processos de estase cariótipica e intensas mudanças cromossômicas exemplificam fenômenos extremos de mudanças cariotípicas. Alguns grupos de peixes marinhos apresentam essas duas condições refletidas nos cariótipos de suas espécies. Um desses grupos, Pomacanthidae apresenta 12% das espécies com cariótipos com elevado grau de conservadorismo do número diploide (2n=48), mas com estruturas cariotípicas que podem ser muito divergentes. Aqui são apresentados dados citogenéticos de seis espécies da família, Pomacanthus paru, P. arcuatus, Holacanthus tricolor, H. ciliaris, Centropyge aurantonotus (oceano Atlântico), e C. eibli (oceano Índico), obtidos por métodos convencionais e hibridização fluorescente in situ de quatro classes de DNA repetitivos (DNAr, microssatélites, elementos transponíveis, histonas) que demonstram a diversidade cariotípica e padrões contrastantes de evolução cromossômica do grupo. As espécies analisadas compartilham um mesmo número diploide (2n=48), com cariótipos formados principalmente por cromossomos acrocêntricos, exceto C. aurantonotus que exibe grande profusão de elementos bi-braquiais. Apesar do conservadorismo númérico e estrututral dos cariótipos, ocorreram variações na distribuição e organização de algumas classes de DNA repetitivo. Todas as espécies exibiram apenas um lócus DNAr 18S, enquanto que as regiões DNAr 5S se mostraram mais variáveis, ocorrendo em diversos cromossomos de C. aurantonotus. P. paru e P. arcuatus, com divergência recente exibem cariótipos muito similares, incluindo os arranjos dos sítios 18S DNAr, mas diferem quanto ao posicionamento das regiões DNAr 5S. As espécies de Holacanthus apresentaram consideráveis variações em número e posição dos sítios de histona H4. A ocorrência de traços evolutivos relacionados à estrutura cromossômica e organização de sequências repetitivas em algumas espécies, indicam eventos disruptivos sobre a limitada diversificação cariotípica do grupo, mediados por inversões pericêntricas e processos de heterocromatinização.Dissertação Dinâmica evolutiva do DNAr em cromossomos de peixes da família Eleotridae e revisão citogenética da ordem gobiiformes (Osteichthyes, Teleostei)(2019-02-27) Silva, Simião Alefe Soares da; Molina, Wagner Franco; Lima Filho, Paulo Augusto de; ; ; ; Motta Neto, Clóvis Coutinho da; ; Costa, Gideão Wagner Werneck Felix da;A ordem Gobiiformes, com mais de 2.200 espécies é um dos grupos mais diversificados dentre os teleósteos. Essa alta diversidade é acompanhada por significativa diversificação cariotípica, cujas causas biológicas não são completamente estabelecidas. Dentre seus grupos encontra-se a família Eleotridae, com 23 gêneros e 171 espécies, das quais seis habitam rios próximos à costa e regiões estuarinas em vastas áreas do litoral brasileiro. Com vistas a ampliar os dados citogenéticos para Eleotridae e revisar os padrões de diversificação cariotípica em Gobiiformes, aqui foram analisadas as espécies Dormitator maculatus, Eleotris pisonis, Erotelis smaragdus e Guavina guavina com ocorrência no Atlântico Sul e realizada uma ampla revisão citogenética e associação com os aspectos biológicos e ecológicos da Ordem Gobiiformes. As análises citogenéticas empregaram metodologias convencionais (coloração com Giemsa, impregnação por nitrato de prata, bandamento-C), coloração com fluorocromos base-específicos (MM/DAPI) e mapeamento por hibridação in situ fluorescente com sondas DNAr 18S, 5S e de sequências microssatélites (CA)15. As espécies E. smaragdus e E. pisonis apresentaram 2n=46 cromossomos (NF=46), D. maculatus exibiu um cariótipo estruturalmente diversificado, com 36sm+4st+6a (NF=86), enquanto G. guavina um cariótipo numericamente divergente com 2n=52 (NF=52). As regiões organizadoras nucleolares nas quatro espécies, estão localizadas em diferentes posições de um único par cromossômico, revelando-se em um efetivo marcador citotaxonômico entre as espécies. O mapeamento in situ do DNAr indicou uma significativa variação de arranjos estruturais dos genes 18S e 5S, confirmando a elevada dinâmica evolutiva dos cariótipos dessas espécies. O conjunto de dados citogenéticos confirma 2n=46 cromossomos acrocêntricos, como uma condição simplesiomórfica para Gobiiformes. O variado conjunto de sequências repetitivas nos cromossomos das espécies de Eleotridae, e em Gobiiformes em geral, pode atuar como fator promotor de diversificação cariotípica, associado a características biológicas, como hábitos bentônicos e ovos adesivos bentônicos. Os resultados encontrados contribuem para um melhor conhecimento da evolução cariotípica da família Eleotridae, indicando a participação de variados rearranjos (inversões, fusões e fissões) e amplia as informações citogenéticas para Gobiiformes. Os padrões estruturais heterogêneos dos cromossomos desta Ordem de peixes, aliado aos seus aspectos biológicos que favorecem estruturações populacionais elevando a dinâmica evolutiva dos cromossomos, tornando este grupo um dos modelos mais ilustrativos de megaevolução cariotípica em ambientes marinhos.Tese Diversificação citogenômica em serranidae (Perciformes), um modelo de estase cariotípica: aspectos evolutivos e aplicados(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2020-03-13) Amorim, Karlla Danielle Jorge; Molina, Wagner Franco; ; ; Motta Neto, Clóvis Coutinho da; ; Bertollo, Luiz Antonio Carlos; ; Cioffi, Marcelo de Bello; ; Lima Filho, Paulo Augusto de;A família Serranidae, cujos representantes são conhecidos como garoupas, constitui um dos mais diversos grupos de peixes em ambientes recifais. São predadores eficientes que podem ocupar desde poças de maré a recifes profundos. Algumas espécies podem alcançar porte considerável e, em geral, significativo valor econômico. Com distribuição circunglobal, o grupo é composto por 577 espécies, distribuídas em 75 gêneros, dos quais Epinephelus é o mais representativo. Apesar do crescente conjunto de informações genéticas, menos de 10% das espécies apresentam aspectos citogenéticos conhecidos. Abordagens citogenéticas para a família se mostram dissociadas quanto aos seus aspectos filogenéticos, geográficos e taxonômicos, limitando a compreensão de seus aspectos evolutivos e aplicados ao manejo. No presente trabalho, análises citogenéticas convencionais e mapeamento por hibridização in situ fluorescente das sequências DNAr 18S, DNAr 5S, elementos transponíveis Tol2 e Rex3, microssatélites (CA)15, (GA)15, (CAA)10 e (CGG)10, foram realizadas em 11 espécies de Serranidae. O primeiro capítulo pretende comparar a distribuição de sequências repetitivas dentro do cenário filogenético e em diferentes regiões biogeográficas. Em virtude das informações citogenéticas estarem concentradas no gênero Epinephelus, o segundo capítulo traz informações citogenômicas para outras três espécies da família dos gêneros Cephalopholis e Rypticus. No terceiro capítulo análises citogenômicas de três espécies de garoupas de interesse comercial foram realizadas para gerar informações sobre a organização dos cromossomos e o nível de divergência cromossômica entre as espécies, além de aspectos adaptativos e potencialidades aplicáveis à práticas de hibridização interespecífica. Todas as espécies apresentaram 2n=48, das quais apenas três possuem cariótipos não compostos exclusivamente por elementos acrocêntricos. O conservadorismo cariotípico, apenas perturbado por inversões pericêntricas, se estende à organização do DNA repetitivo onde as sequências repetitivas aqui analisadas refletem um baixo dinamismo evolutivo. A divergência citogenética e genômica entre espécies decorrente de ancestralidade comum ocorrida em períodos entre 15 a 11 M.a aparentemente proporciona reduzido nível de bloqueio reprodutivo pós-zigótico, com valiosas implicações para a hibridização induzida na aquicultura. Sob perspectiva biogeográfica e filogenética, os grupos mais basais do Atlântico apontam 2n=48a como o padrão ancestral para a família, indica que a especiação no grupo não foi seguida por modificações cariotípicas significantes e a despeito de uma relativa frequência de cariótipos divergentes, esse grupo de peixes se adequa a um padrão evolutivo de estase cariotípica.Tese Evolução cariogenômica em peixes recifais das famílias Acanthuridae (Acanthuriformes) e Holocentridae (Holocentriformes)(2019-08-30) Fernandes, Maria Aparecida; Molina, Wagner Franco; ; ; Motta Neto, Clóvis Coutinho da; ; Costa, Gideão Wagner Werneck Felix da; ; Scortecci, Katia Castanho; ; Lima Filho, Paulo Augusto de;As famílias Acanthuridae e Holocentridae constituem grupos de peixes marinhos com alta representatividade em recifes de corais, onde desempenham importantes funções ecológicas no equilíbrio ambiental. Aspectos biológicos, filogeográficos e taxonômicos destas famílias são amplamente conhecidos, contudo, seus aspectos citogenéticos são incipientes. Com vistas a ampliar o conhecimento acerca da evolução cariotípica e possíveis variações citogenéticas interpopulacionais foram analisadas quatro espécies de Acanthuridae (A. coeruleus, A. bahianus e A. chirurgus – Atlântico Ocidental; e Acanthurus triostegus - Índico) e três espécies de Holocentridae (Myripristis jacobus, Holocentrus adscensionis – Atlântico Ocidental; e Sargocentron rubrum – Índico). As análises utilizaram técnicas citogenéticas convencionais, coloração com fluorocromos base-específicos e mapeamento de sequências repetitivas DNAr 18S, DNAr 5S, histonas H3 e H2B-H2A, microssatélites (GA)15, transposons Tol2 e retrotransposon Rex3, através da hibridação fluorescente in situ. Entre os Acanthuridae, A. triostegus apresentou um padrão cariotípico considerado basal para Percomorpha (2n=48; NF=48), enquanto as espécies do Atlântico Ocidental exibiram uma divergência cariotípica sequencial associada à divergência filogenética. Variação interpopulacional de sítios DNAr 18S foi identificada entre populações de A. coeruleus do Atlântico Ocidental e do Caribe. O mapeamento de sítios DNAr 18S, DNAr 5S, DNAhis H2B-H2A e H3 mostraram padrões microestruturais no gênero Acanthurus. As espécies de holocentrídeos M. jacobus e S. rubrum apresentaram 2n=48 cromossomos acrocêntricos, enquanto H. adscensionis, 2n=50 (2m+6sm+16st+26a). Neste grupo os sítios DNAr 18S e 5S constituem marcadores citotaxonômicos discriminantes, onde elementos Rex e repetições microssatélites (GA)15 se mostraram co-localizados. Apesar das amplas distâncias geográficas não foram evidenciadas variações interpopulacionais em M. jacobus e H. adscensionis. Os resultados obtidos, indicaram uma evolução horotélica e mais diversificada nas espécies de Acanthurus do Atlântico, com diversificação mais recente, em relação a A. triostegus, pertencente ao Indo-Pacífico, centro de origem deste grupo. Enquanto a presença de cariótipos 2n=48a em espécies de Holocentrinae (Sargocentron) e Myripristinae (Myripristis), destaca o compartilhamento de uma condição conservada em Percomorpha e sugere uma condição ancestral para a Holocentriformes. Ambos os grupos revelam divergências filogenéticas, mas também a manutenção de homeologias cromossômicas, e eventuais indícios de variação populacional (A. coeruleus), destacando a importância das análises citogenômicas correlacionadas aos padrões biogeográficos na compreensão das mudanças cariotípicas em grupos marinhos.Dissertação Haemulidae, modelo cariotípico de estase evolutiva(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2011-11-26) Motta Neto, Clóvis Coutinho da; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/8790601797102483; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146; Vicari, Marcelo Ricardo; ; http://lattes.cnpq.br/9824170107078686Os perciformes constituem o maior e mais diversificado grupo de peixes. Uma parcela considerável de suas espécies apresenta um marcante conservadorismo cromossômico exibindo um padrão caracterizado por 2n=48a, NF=48, que tem sido apontado como uma condição basal para a Ordem. Blocos heterocromáticos reduzidos e RONs simples são característicos para este grupo de peixes. No entanto, não se encontra ainda bem estabelecido se este conservadorismo se deve, em parte, a dados provenientes de bandamentos cromossômicos pouco resolutivos, como os convencionalmente utilizados nas caracterizações citogenéticas das espécies marinhas ou a uma condição peculiar cariotípica deste grupo. Visando clarificar os processos envolvidos no peculiar conservadorismo cromossômico observado nesta Ordem, cinco espécies da família Haemulidae foram submetidas à variadas técnicas citogenéticas como coloração com Giemsa, bandamento C e impregnação por nitrato de prata, bem como digestão com enzimas de restrição (AluI, TaqI, PstI e EcoRI), bandamento de replicação pela incorporação do análogo de base 5 BrdU, coloração com os fluorocromos CMA3/MM e DAPI, double FISH com sondas para as subunidades ribossomais 5S e 45S, sendo também analisadas morfometricamente através de morfometria geométrica (MG). Os dados obtidos permitiram identificar um alto grau de similaridade cariotípica neste grupo independente do nível de resolução das técnicas utilizadas. As espécies Conodon nobilis, Pomadasys corvinaeformis, Haemulon aurolineatum, H. plumierii e H. steindachneri apresentaram uma macroestrutura cariotípica comum composta por 2n=48a (NF=48), com RONs simples localizadas em um mesmo par cromossômico (24° par) nas espécies C. nobilis, H. aurolineatum H. plumierii e H. steindachneri e em outro par em P. corvinaeformis (18° par), considerando-se estas regiões caracteres citotaxonômicos pouco importantes. O padrão heterocromático apresentou-se similar para todas as espécies, observando-se reduzidos blocos heterocromáticos detectados preferencialmente em região centroméricas e em menor número em regiões pericentroméricas e teloméricas. Contrastando com a reduzida diferenciação cromossômica observada, as análises por MG indicaram uma conspícua diferenciação morfológica entre as espécies. Condições ambientais com reduzidas barreiras biogeográficas, características biológicas, decorrente da presença de grandes contingentes populacionais uniformemente distribuídos em largas áreas costeiras, que promoveriam a manutenção do fluxo gênico dentro das populações, associadas às características cariotípicas peculiares, poderiam desempenhar uma ação sinérgica contribuindo para a evolução braditélica do cariótipo nas espécies de HaemulidaeTese Interações agonísticas em pares de espécies inter e cogenéricos e diversificação citogenética na família Osphronemidae(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2023-09-29) Faria, Camila Fernanda Almeida de; Molina, Wagner Franco; https://orcid.org/0000-0002-6695-0952; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; http://lattes.cnpq.br/5000402126927493; Motta Neto, Clóvis Coutinho da; Hoyos, Daniela Chemim de Melo; Padilha, Deborah de Melo Magalhães; Gomes, Veruska Dilyanne SilvaA variabilidade genética e fenotípica intra e interespecíficas são aspectos essenciais ao melhoramento genético. Neste sentido, acasalamentos em peixes com bases genéticas evolutivamente distintas têm contribuído para obtenção de produtos funcionais e com notável valor mercadológico. Híbridos interespecíficos artificiais com fins ao mercado ornamental têm aprimorado características morfológicas, fisiológicas ou comportamentais de interesse econômico. Dentre as espécies mais comercializadas mundialmente, destaca-se a espécie Betta splendens (Osphronemidae), que por sua beleza e rusticidade, movimenta uma enorme cadeia produtiva. Devido ao marcante dimorfismo sexual e elevado nível de interações agonísticas entre os machos, essa espécie é chamada de peixe-de-briga, sugerindo primariamente características morfológicas modeladas por seleção sexual intra-sexual. Análises dos mecanismos de isolamento reprodutivo pré e pós-zigóticos envolvendo os gêneros Betta, Trichogaster, Trichopodus e Macropodus se fazem necessárias ao seu manejo em cativeiro e no desenvolvimento de protocolos de hibridização na família. Assim, foram investigados bloqueios reprodutivos pré-zigóticos através de análises das interações de corte em cruzamentos interespecíficos e intergenéricos na família Osphronemidae e dos padrões citogenéticos das espécies. O primeiro capítulo acessa o isolamento comportamental reprodutivo de espécies da família e associações com o nível de proximidade filogenética. O segundo capítulo explora a diversificação citogenética de seis espécies de Osphronemídeos de interesse comercial e sua possível participação como mecanismo de isolamento reprodutivo pós-zigótico, direcionando práticas potencialmente aplicáveis à hibridização interespecífica e incremento mercadológico da família.