Navegando por Autor "Lima, Matheus Miguel Soares de Medeiros"
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Dissertação Investigando a taxonomia de Enterococcus casseliflavus e espécies relacionadas(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2024-09-27) Lima, Matheus Miguel Soares de Medeiros; Sakamoto, Tetsu; Prichula, Janira; https://orcid.org/0000-0003-3023-0117; http://lattes.cnpq.br/1342530085695810; http://lattes.cnpq.br/0633141683260861; Lima, Lucymara Fassarella Agnez; Aburjaile, Flávia FigueiraEnterococcus casseliflavus, uma bactéria comumente móvel e de coloração amarela, e um membro comensal do trato gastrointestinal de vertebrados e invertebrados. Ela é ocasionalmente encontrada em casos de bacteremia e outras infecções humanas. Uma preocupação é que todas as cepas dessa espécie possuem o grupo de genes vanC em seu cromossomo, que confere resistência à vancomicina. A classificação de E. casseliflavus e bastante complexa, apresenta 99% de identidade na análise 16S com E. gallinarum e, principalmente, com E. flavescens, sendo frequentemente classificadas como uma única espécie. Tendo em vista essa problemática, esse estudo visou investigar a taxonomia de E. casseliflavus e outras espécies relacionadas realizando análises dos dados genômicos disponíveis em bancos de dados públicos. Para isso, 155 genomas de espécies relacionadas à E. casseliflavus (E. casseliflavus, E. flavescens, E. entomosocium e E. innesii) foram resgatados e submetidos a análise de Identidade Média de Nucleotídeos (ANI), análise de pangenoma e filogenômica. As abordagens mostraram três grupos bem definidos correspondentes a três espécies de Enterococcus (E. casseliflavus, E. flavescens e E. innesii). Com características de pangenoma aberto, o grupo mostrou grande conservação de genes centrais e alta diversidade de genoma acessório. Aqui sugerimos a remoção do estado de espécies sinônimas entre as espécies E. flavescens e E. casseliflavus e a adição do estado de espécies sinônimas entre E. entomosocium e E. casseliflavus.