Navegando por Autor "Justino, Josivan Ribeiro"
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Artigo An integrated approach to identify bimodal genes associated with prognosis in cancer(FapUNIFESP (SciELO), 2021-07-08) Justino, Josivan Ribeiro; Reis, Clovis Ferreira dos; Fonseca, André Luiz; Souza, Sandro José de; Stransky, BeatrizBimodal gene expression (where a gene expression distribution has two maxima) is associated with phenotypic diversity in different biological systems. A critical issue, thus, is the integration of expression and phenotype data to identify genuine associations. Here, we developed tools that allow both: i) the identification of genes with bimodal gene expression and ii) their association with prognosis in cancer patients from The Cancer Genome Atlas (TCGA). Bimodality was observed for 554 genes in expression data from 25 tumor types. Furthermore, 96 of these genes presented different prognosis when patients belonging to the two expression peaks were compared. The software to execute the method and the corresponding documentation are available at the Data access sectionTese Análise da difusão tempo-espacial da Covid-19 em dois estados brasileiros(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2024-08-27) Campos, Maria da Luz Góis; Aguirre, Moisés Alberto Calle; André, Diego de Maria; https://orcid.org/0000-0003-3142-8336; http://lattes.cnpq.br/6480130040427049; http://lattes.cnpq.br/0743856406326460; http://lattes.cnpq.br/6145999964755917; Queiroz, Silvana Nunes de; Alves, Janaina da Silva; Alves, Janaina da Silva; Justino, Josivan Ribeiro; Soares, WeberA pandemia do SARS-CoV-2 provocou efeitos consideráveis na economia e na demografia mundial, bem como assolou regiões com populações mais vulneráveis, tanto socialmente, como em termos de condições de saúde e sanitárias, conforme aborda a vasta literatura. É nesse diapasão, que este estudo tem como principal objetivo estudar o fluxo da propagação da infecção da COVID-19 para os estados do Rio Grande do Norte (RN) e do Amazonas (AM). Assim, usando dados da Secretaria de Saúde Pública (SESAP) do estado potiguar e do IBGE – Censo 2010, analisamos a incidência da COVID-19 para o período da 1ª onda pandêmica de 22 de março de 2020 a 29 de novembro de 2020 e dados em corte transversal da semana epidemiológica SE49 (23/11/2020 a 29/11/2020). Portanto, trata-se de uma pesquisa exploratória descritiva em corte transversal, cujo fundamento empírico é o de analisar modelos espaciais globais e locais para modelar a incidência da COVID-19 nos 167 municípios potiguares e seus principais determinantes socioeconômicos e demográficos. Do ponto de vista metodológico, descrevemos a presença de autocorrelação espacial e formação de clusters, utilizando Análise Exploratória de Dados Espaciais (AEDE). Observou-se a presença de heterogeneidade espacial para a incidência de COVID-19 nos municípios do RN, a qual permite ajustar para os indicadores de identificação da vulnerabilidade social um modelo Misto de Regressão Geograficamente Ponderada Autorregressivo Espacial (MGWRSAR) como principal instrumento de análise. Da perspectiva dos resultados, demonstra-se que os coeficientes das variáveis de estudo apresentaram padrões de associações com os fatores socioeconômicos e demográficos, sendo, portanto, o índice de Gini (Gini) e a concentração urbana (Gurb) os fatores mais relevantes para explicar a difusão da doença para o estado do RN. Os resultados dos clusters de correlação da incidência da COVID-19 sustentam a conclusão de que os fluxos inter-regionais gerados pelas atividades dos centros maiores para os menores, mediante transbordamentos espaciais da doença, iniciaram-se a partir das microrregiões de Mossoró e do Seridó Ocidental e Oriental e da concentração urbana de Natal-RN. Já para o estudo da extensa propagação do coronavírus da síndrome respiratória aguda grave (SARSCoV-2) no estado do Amazonas, utilizamos dados do MonitoraCovid-19/Fiocruz e da Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas (FVS-AM) no período de 09 de março de 2020 a 25 de abril de 2021. Do ponto de vista metodológico, utilizamos um estudo experimental e ecológico descritivo, usando a modelagem de simulação dinâmica contínua por meio de sistemas dinâmicos, com ênfase no modelo epidemiológico comportamental, suscetível, infectado, recuperado e mortos (SIRD-AM), para além da análise estatística. Esse procedimento de análise tem por objetivo estimar cenários alternativos, fundamentando-se nas medidas de distanciamento social impostas pelo governo estadual do Amazonas, bem como na capacidade hospitalar, a nível da população, para prever mortes e casos por COVID-19. Da perspectiva dos resultados, simulamos em 5 vezes mais mortos para o Amazonas; quando consideramos a capacidade hospitalar, estimamos uma taxa de excesso de mortalidade de 411% maior que a brasileira para 2021 e os fluxos I(t), R(t) e D(t) decresceram a uma taxa média de 2,5, em prol das políticas de controle da pandemia. Em particular, esse estudo contribui com a discussão da incidência da COVID-19 a partir das variações espaço sociais regionais em nível municipal para o Rio Grande do Norte, bem como produziu uma modelagem epidemiológica necessária para a saúde pública entender a população e suas necessidades em termos de vigilância sanitária, quando se trata da pandemia da COVID-19, para Amazonas, epicentro da COVID-19 no Brasil.Tese Dinâmica migratória e trajetória acadêmica no ensino superior: o caso dos/as estudantes da Universidade Integração Internacional da Lusofonia Afro-Brasileira(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2024-12-27) Costa, Renato Tigre Martins da; Aguirre, Moisés Alberto Calle; http://lattes.cnpq.br/0743856406326460; http://lattes.cnpq.br/1599469691199961; Tavares, Carlos Mendes; Cerqueira, Cezar Augusto; Morales, Fidel Ernesto Castro; Justino, Josivan Ribeiro; Queiroz, Silvana Nunes deA análise das dinâmicas migratórias entre cursos acadêmicos no ensino superior é essencial para compreender os fatores que impactam a trajetória dos/as estudantes universitários e embasar a formulação de políticas voltadas para a permanência e o sucesso acadêmico. Essas transições refletem escolhas individuais influenciadas por interesses, condições sociais, e estrutura institucional, e apresentam implicações significativas tanto para os estudantes quanto para as universidades. Ao investigar como os/as estudantes se distribuem e redistribuem entre cursos, é possível identificar padrões de migração interna, avaliar a atratividade de diferentes áreas de conhecimento e propor estratégias que promovam a conclusão dos cursos por parte dos/as estudantes. Esta tese tem como objetivo analisar os padrões de migração intercursos e os fatores associados às trajetórias acadêmicas de estudantes de quatro cursos da UNILAB, considerando movimentos migratórios internos e seus impactos nas taxas de evasão e conclusão entre 2014 e 2022. Secundando pelos objetivos específicos: 1 - Identificar e descrever os fluxos de migração intercursos dos estudantes da UNILAB entre 2014 e 2022, utilizando uma matriz de origem e destino para caracterizar a movimentação entre os cursos selecionados. 2 - Investigar, por meio do método multiestado, os fatores associados à trajetória acadêmica dos estudantes de Humanidades, Física, Ciências Biológicas e Enfermagem que ingressaram em 2015, analisando variações nas taxas de evasão, mudança de curso e conclusão até 2020. Para investigar a dinâmica migratória intercursos, foi construída uma matriz análoga à matriz de origem e destino oriunda de estudos relacionados à migração. A partir dos indicadores gerados, foram selecionados dois cursos com as maiores taxas de imigração acadêmica e dois com as menores taxas. A análise das trajetórias acadêmicas foi conduzida por meio do Método Multiestado, aplicado aos quatro cursos selecionados, gerando tabelas de sobrevivência multiestado para estimar as probabilidades de transição e a esperança de vida acadêmica. Os resultados indicam que os cursos de Enfermagem e Ciências Biológicas atraem o maior número de estudantes, enquanto Humanidades e Física apresentam menor atratividade em termos de imigração acadêmica. Novamente os cursos Enfermagem e Ciências biológicas se destacam por apresentarem as maiores probabilidades de transição. Por outro lado, cursos como Física e Humanidades, com menores probabilidades de transição. Além disso, a esperança de vida acadêmica nos cursos analisados supera o tempo regular de conclusão, sugerindo possíveis fatores que prolongam a permanência dos/as estudantes, um dado essencial para aprofundar futuras investigações sobre o tema através de pesquisas qualitativas. Esses resultados oferecem uma oportunidade para se explorar as razões que levam tanto a atratividade quanto a menor retenção de estudantes, contribuindo para o desenvolvimento de estratégias mais eficazes de suporte acadêmico para eles.Dissertação Estimativas de mortalidade para a região nordeste do Brasil em 2010: uma associação do método demográfico equação geral de balanceamento, com o estimador bayesiano empírico(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2013-08-15) Justino, Josivan Ribeiro; ; http://lattes.cnpq.br/7623751650258443; ; http://lattes.cnpq.br/6470296449367089; Gonzaga, Marcos Roberto; ; http://lattes.cnpq.br/3332143224735260; Lima, Everton Emanuel Campos de; ; http://lattes.cnpq.br/0866511972839867; Costa, José Vilton; ; http://lattes.cnpq.br/2024838537927934; Queiroz, Bernardo Lanza; ; http://lattes.cnpq.br/7581282834093314Um dos grandes desafios atuais da demografia é obter estimativas de mortalidade, de maneira consistente, principalmente em pequenas áreas. A carência destas informações, dificulta ações de saúde pública e leva ao comprometimento da qualidade de classificação de óbitos, gerando preocupação por parte dos demógrafos e epidemiologistas na obtenção de estatísticas confiáveis da mortalidade no País. Neste contexto, o objetivo deste trabalho é obter estimativas de fatores de ajuste de óbitos para correção da mortalidade adulta, por estados, mesorregiões e grupos etários na região nordeste, em 2010. A proposta está pautada sobre duas linhas de observação: uma demográfica e outra estatística, considerando também duas áreas de abrangência nos estados da região Nordeste, as mesorregiões como áreas maiores e os municípios como pequenas áreas. O principio metodológico é usar o método demográfico Equação Geral e Balanceamento ou General Growth Balance, para corrigir os óbitos observados, nas áreas maiores (mesorregiões) dos estados, por estas serem regiões menos propícias a quebra dos pressupostos metodológicos. Em seguida, será aplicado o método estatístico estimador bayesiano empírico, considerando como soma dos óbitos nas mesorregiões, o valor de óbito corrigido pelo método demográfico e como referência de observação de área menor os óbitos observados nas pequenas áreas (municípios). Como resultados desta combinação, um efeito de suavização do grau de cobertura dos óbitos é obtido, fruto da associação com o estimador bayesiano empírico e a possibilidade de avaliar o grau de cobertura de óbitos por grupos etários em nível de municípios, mesorregiões e estado, com a vantagem de estimar fatores de ajuste, conforme o nível de agregação desejado. Os resultados agrupados por estado, apontam para uma melhora significante do grau de cobertura de óbitos, segundo a combinação dos métodos com valores acima de 80%. Alagoas (0,88), Bahia (0,90), Ceará (0,90), Maranhão (0,84), Paraíba (0,88), Pernambuco (0,93), Piauí (0,85) , Rio Grande do Norte (0,89) e Sergipe (0,92). Os avanços no controle do registro das informações no sistema de saúde, associado às melhorias nas condições socioeconômicas e de urbanização dos municípios, na última década, proporcionaram uma melhor qualidade do registro das informações de óbitos nas pequenas áreasTese Modelo para identificação de genes bimodais associados ao prognóstico no câncer(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2021-09-16) Justino, Josivan Ribeiro; Souza, Sandro José de; Ferreira, Beatriz Stransky; 62825968668; http://lattes.cnpq.br/3142264445097872; http://lattes.cnpq.br/8479967495464590; http://lattes.cnpq.br/6470296449367089; Torrezan, Giovana; http://lattes.cnpq.br/1174527002469907; Souza, Jorge Estefano Santana de; http://lattes.cnpq.br/8058577659019910; Nunes, Marcus Alexandre; http://lattes.cnpq.br/2698100541879707; Santos, Ândrea Kely Campos Ribeiro dos; http://lattes.cnpq.br/3899534338451625Nas últimas décadas o interesse biológico em compreender a regulação gênica, tem levado a descobertas de genes tumorais com expressões diferenciadas em subgrupos de pacientes. Estes genes possuem um perfil bimodal de distribuição dos valores de expressão, o que têm despertado a atenção para investigar os padrões de desenvolvimento e de sua funcionalidade. Para melhor compreender o padrão bimodal destes genes, o objetivo principal do trabalho foi identificar grupos distintos de pacientes em determinado tipo de tumor, que apresentassem níveis baixo e alto da expressão para o mesmo gene, associados a um melhor ou pior prognóstico de sobrevida do câncer. Desenvolvemos um método que seleciona genes candidatos ao padrão de bimodalidade a partir da função densidade de probabilidade dos valores de expressão. Analisamos 25 tipos de tumor disponíveis no The Cancer Genome Atlas (TCGA), à realizamos análise de sobrevivência usando informações clínicas extraídas do cBioPortal for Cancer Genomics. Utilizamos os dados de expressão em Fragments by Exon Kilobase per Millions of Mapped Fragments (FPKM) para 24.456 genes, e encontramos nos 25 tipos de tumores 554 genes bimodais únicos, dos quais 46 apresentaram expressão bimodal em mais de um tipo de câncer, com maior prevalência no cromossomo Y. Os tumores KIRC, KIRP, LGG, SKCM, THCA e THYM apresentaram amostras consistentes quanto ao prognóstico de sobrevida com p-valor ≤ 0,01. O método mostrou-se eficiente em reduzir os níveis de variabilidade interna dos grupos, principalmente quando analisamos os dados pelo subtipo de câncer. Como contribuição apresentamos um método com o código livre, que possibilita reduzir os níveis de variabilidade interna dos grupos e que relaciona o padrão de expressão bimodal com o prognóstico de sobrevida. Assim, acreditamos que a utilização do método poderá ser útil na avaliação do padrão bimodal de expressão gênica e na descoberta de novos biomarcadores clínicos para diferentes tipos de câncer.Artigo Social network, food patterns, physical activity and associations with overweight and obesity in adolescents from a school in rural Brazil(Nutrients, 2023-07) Maciel, Bruna Leal Lima; Aguirre, Maria de Jesus Xavier; Andrade, Flavia Cristina Drumond; Aguirre, Moisés Alberto Calle; Justino, Josivan RibeiroThe objective of this study was to evaluate the social network, food patterns, physical activity, and their associations with overweight/obesity in adolescents from a school in rural Brazil. Students from a rural school in Northeast Brazil (n = 90) completed questionnaires on sociodemographic characteristics, food consumption, physical activity, and a name generator. Social networks were constructed using students’ social proximity ties. Principal component analysis was performed to determine food patterns, and logistic models were used to investigate variables associated with overweight/obesity. Most participants were girls (62.9%), and the proportion of overweight/obesity was 30% among adolescents. Students cited 2070 people from their networks (family, friends at school, friends outside of school, and others). Among them, the family had the highest degree of influence (61%) in the network and had the most shared meals with adolescents (47%). Adolescents’ perception of their family members’ body size as obese, compared to normal or underweight, was prevalent (51%). Adolescents with unhealthy food patterns were 72% more likely to be categorized as overweight/obese, and eigenvector centrality was also associated with overweight/obesity (OR = 5.88, 95% CI = 1.08–32.03). Adolescents presented a social network with strong family influence, in which a high percentage of overweight/obesity was observed. Adolescents with high eigenvector centrality were more likely to be in the overweight/obesity category. Additionally, overweight/obesity was associated with unhealthy food patterns in the family network