Navegando por Autor "Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção"
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TCC Análise comparativa de metagenomas de transportes públicos(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2025-01-17) Silva, Marcos Guilherme da Costa; Medeiros, Silvia Regina Batistuzzo de; https://orcid.org/0000-0003-2431-0479; http://lattes.cnpq.br/5882662534904226; http://lattes.cnpq.br/7243708323682768; Dalmolin, Rodrigo Juliani Siqueira; https://orcid.org/0000-0002-1688-6155; http://lattes.cnpq.br/4065178015615979; Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção; http://lattes.cnpq.br/3673464953672300Transportes públicos são áreas de alto fluxo de pessoas e densidade populacional, elementos característicos do ambiente urbano, e constituem ecossistemas complexos de microrganismos influenciados pelo movimento humano. O grande trânsito de pessoas viabiliza o transporte de microrganismos patogênicos como vírus e bactérias. O fluxo de organismos patogênicos tem estado em voga devido à recente pandemia, bem como pelo abundante fluxo de diversos tipos de bactérias responsáveis pela maioria das doenças infecciosas emergentes. Os métodos de análise da área de metagenômica são eficientes devido a sua capacidade de estudo sem necessidade de cultivo, aliado a isso, temos o uso do sequenciamento de próxima geração (do inglês, NGS) como alternativa para análise de grandes quantidades de organismos diversos e permitindo uma gama de manipulações de dados por meio do uso de ferramentas de bioinformática, sendo um avanço para análises taxonômicas e de anotação funcional. Em 2015, foi fundado o consórcio internacional Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB), visando coletar, isolar e sequenciar amostras coletadas de transportes públicos, contendo em seu banco de dados, aberto ao público, 5936 amostras de mais de 70 cidades em 28 países. Recentemente, um grupo de pesquisa do Laboratório de Biologia Molecular e Genômica (LBMG) da UFRN realizou um estudo com a coleta de amostras de swabs do interior de ônibus para identificação do microbioma dos transportes públicos de Natal, resultando em sequências de material genético que traçam um panorama dos organismos encontrados nesses ambientes na cidade. Este estudo propõe a observação dos microrganismos do interior de transportes públicos em 9 cidades ao redor do mundo, disponibilizadas pelo banco de dados do consórcio MetaSUB, e a comparação dos resultados dos transportes da cidade de Natal, visando determinar as semelhanças e discrepâncias entre os microbiomas estudados, tendo como resultado que cerca de 31% dos organismos aparecem em todas as cidades selecionadas, com essa proporção refletindo as espécies mais encontradas de forma geral. Cutibacterium acnes é a espécie mais abundante na maioria das regiões. Bactérias são predominantes, com destaque para o grupo ESKAPE dentre as de maior risco à saúde. O microbioma de Natal corresponde ao esperado para o ambiente analisado, com média próxima a 1.0e+07 de leituras por amostra, a segunda maior, e presença significativa das espécies Lawsonella clevelandensis e Phreatobacter oligotrophus, incomuns em relação às cidades vistas.Tese Avaliação da espécie vegetal Croton cajucara Benth como inibidor de biocorrosão em aço carbono Aisi 1020(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2012-07-31) Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção; Silva, Djalma Ribeiro da; ; http://lattes.cnpq.br/2791074318745945; ; http://lattes.cnpq.br/3673464953672300; Huitle, Carlos Alberto Martinez; ; http://lattes.cnpq.br/2485073932883264; Tonholo, Josealdo; ; http://lattes.cnpq.br/6333407087554681; Souza, Kátia Regina; ; Maciel, Maria Aparecida Medeiros; ; http://lattes.cnpq.br/5360188002708095; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8Na indústria petrolífera problemas relacionados a processos corrosivos em estruturas metálicas representam um desafio voltado para questões biotecnológicas. Esses processos podem ser significantemente influenciados pela presença de microorganismos que afetam a cinética eletroquímica da interface ambiente/superfície metálica (biocorrosão). Neste contexto, a substituição de inibidores sintéticos tóxicos por produtos naturais bioaceitáveis constitui uma alternativa economicamente importante com minimização de impactos ambientais. No presente trabalho um dos objetivos principais está vinculado ao emprego de química verde, em que foram avaliados extratos da casca do caule (extrato hidroalcoólico denominado de EHC) e folhas (extrato clorofórmio, ECF) da espécie vegetal Croton cajucara Benth. Em adição a eficácia de inibição à corrosão do clerodano bioativo trans-desidrocrotonina (DCTN) isolado das cascas do caule deste Croton também foi avaliada. Para tanto, utilizou-se aço carbono AISI 1020 imerso em solução salina, sob influência de microrganismo recuperado de uma amostra de petróleo, bem como na sua ausência. As eficiências de inibições à corrosão e seus mecanismos foram investigados através das técnicas de voltametria de varredura linear e impedância eletroquímica. Técnicas dependentes de cultura e de biologia molecular foram utilizadas na identificação de espécies bacterianas presentes em amostras de petróleo. Os extratos EHC, ECF e o composto DCTN veiculados em DMSO, apresentaram respectivamente, eficiências de inibições à corrosão em meio abiótico, com máximas de 57,6% (500 ppm), 86,1% (500 ppm) e 54,5% (62,5 ppm). Com relação ao processo de adsorção, EHC se ajustou a isoterma de Frumkin e ECF a isoterma de Temkin. No entanto, o extrato EHC (250 ppm) veiculado em uma microemulsão polar (SME-EHC) com eficiência máxima de inibição 93,8%, se ajustou a isoterma de Langmuir. Na presença da espécie bacteriana caracterizada Pseudomonas sp., os extratos EHC e ECF formaram filmes ecocompatíveis protetores com ação anti-corrosivaTCC Avaliação da mutagenicidade de microesferas à base de hidroxiapatita nanoestruturada pelo teste de reversão da Salmonella typhimurium(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2022-12-09) Silva, Míria Maria Anjo da; Moreira, Susana Margarida Gomes; https://orcid.org/0000-0002-8333-3016; http://lattes.cnpq.br/7741233949116498; Lanza, Daniel Carlos Ferreira; https://orcid.org/0000-0002-1341-4814; http://lattes.cnpq.br/6851351991421755; Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção; http://lattes.cnpq.br/3673464953672300Lesões ósseas causadas por doenças degenerativas, infecções, traumas ou tumores são uma dificuldade para a medicina atual, pois o tratamento considerado “padrão ouro” - os transplantes autólogos - apresentam algumas limitações. A hidroxiapatita (HA) é um material biocerâmico já conhecido pelo seu potencial osteoindutor e osteocondutor que permite modificações na sua estrutura e composição que potencializam a sua ação regenerativa. Assim, o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Medicina Regenerativa (REGENERA) tem desenvolvido microesferas à base de HA nanoestruturada contendo substituição com diferentes íons visando otimizações nesses materiais para futuras aplicações clínicas. Órgãos regulamentadores, como a Organização para a Cooperação e Desenvolvimento Econômico (OECD), solicitam a avaliação da mutagenicidade como um dos parâmetros exigidos para atestar a biocompatibilidade de fármacos e biomateriais, sendo o teste de reversão em Salmonella typhimurim um dos mais indicados para esse fim. Para analisar o potencial mutagênico das microesferas à base de HA nanoestruturada, nesse estudo foram utilizadas as cepas TA100 e TA98. Inicialmente, as cepas foram avaliadas quanto à sua taxa de reversão espontânea e reversão induzida por mutágenos, seguidos os protocolos estabelecidos. As células foram expostas às amostras, na presença e ausência do extrato lisossomal de células hepáticas de camundongos (fração S9), de modo a avaliar, também, a mutagenicidade dos produtos da metabolização das amostras. Os resultados indicam que a ausência de mutagenicidade das amostras analisadas em ambas as cepas, com e sem tratamento com a fração S9, sendo observada uma razão de mutagenicidade (RM) inferior a 2 em todos os ensaios.TCC Citotoxicidade e genotoxicidade do reteno: um hidrocarboneto policíclico aromático marcador da queima de biomassa(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2019-11-05) Castro, Denis Elvis Farias de; Medeiros, Silvia Regina Batistuzzo de; Sisenando, Herbert Ary Arzabe Antezama Costa Nobrega; Felipe, Maria Beatriz Mesquita CansançãoO reteno (RET) é um hidrocarboneto policíclico aromático (HPA) liberado na queima de biomassa e usado como biomarcador da combustão de madeira de coníferas no ambiente aéreo. Embora não seja considerado como um dos HPAs prioritários e não esteja incluído nas avaliações de risco pela Agência de Proteção Ambiental dos EUA (US-EPA), os poucos estudos que existem com o reteno, indicam que o mesmo é capaz de gerar estresse oxidativo, causando citotoxicidade. A fim de contribuir para o esclarecimento de sua função, o presente estudo teve como objetivo avaliar se o RET, em concentrações semelhantes ao encontrado no ambiente, causa danos celulares e genéticos em linhagem celular de ovário de hamster chinês (CHO). Para isso, realizou-se dois experimentos: o teste de viabilidade celular pela taxa de redução do MTT em cristais de formazan e o ensaio de Micronúcleo com Bloqueio de Citocinese (CBMN). Os resultados revelaram uma diminuição de células viáveis nas concentrações mais altas do RET durante 24 horas de tratamento, trazendo uma resposta dose-dependente. A exposição durante o respectivo tempo levou a um aumento significativo na frequência de micronúcleos (MN), pontes nucleoplásmicas (NPBs) e brotos nucleares (NBUDs) de acordo com o aumento da concentração desse poluente. Assim, enfatiza-se a importância de incluir o RET em análises ambientais de rotina no futuro.TCC Estudo metagenômico microbiano em transportes públicos circulantes na região metropolitana de Natal/RN durante o inverno(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2023-07-14) Santos, Gabrielle Germek Coelho; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção; http://lattes.cnpq.br/3673464953672300; https://orcid.org/0000-0003-2431-0479; http://lattes.cnpq.br/5882662534904226; http://lattes.cnpq.br/0824213140689567; Araújo, Josélio Maria Galvão de; https://orcid.org/0000-0003-3548-2786; http://lattes.cnpq.br/6430774978643765; Minnicelli, Carolina Fonseca; https://orcid.org/0000-0002-5994-1513; http://lattes.cnpq.br/0236314764075499O conhecimento sobre microrganismos cresce cada vez mais, em virtude da sua grande relevância no âmbito científico e da saúde. A diversidade microbiana é bastante ampla, porém, ainda que existam microrganismos com propriedades benéficas para com outros organismos, há aqueles que representam ameaça à saúde humana, tornando-os alvos de estudos e estratégias para seu combate e controle. No entanto, pouco se sabe sobre a presença de microrganismos e suas interações em espaços urbanos, principalmente em sistemas de transporte público. O presente trabalho teve como objetivo a identificação da comunidade microbiana existente nos ônibus circulantes no município de Natal/RN. Para tal, foram realizadas coletas de amostras nas superfícies de 67 ônibus distribuídos em várias linhas que circulam pela cidade durante o período de inverno (18/07/2022 até 21/09/2022). Executou-se a extração do material genético viral e bacteriano, e a checagem do seu rendimento e pureza no NanoDrop e Qubit. Foram feitas as bibliotecas genômicas, e seus rendimentos analisados no Qubit e Bioanalyzer. O sequenciamento foi realizado pelo Illumina NextSeq 1000 e as análises iniciais em Bioinformática foram efetuadas na plataforma KBase. Os resultados parciais revelaram baixas concentrações e rendimentos das amostras pós-extração, tendo apenas três amostras com valores suficientemente bons para elaboração das bibliotecas (DNA Bac A2: 0,18 ng/µL; DNA Viral A2: 0,04 ng/µL; DNA Bac B: 0,46 ng/µL). Contudo, ao analisar os perfis das bibliotecas genômicas pós-sequenciamento e seus dados estatísticos, observou-se qualidades significativas dessas bibliotecas. O número de sequências para DNA bacteriano A2, DNA Viral A2 e DNA Bacteriano B foi de 14.844.879, 18.805.942 e 18.288.666, respectivamente, e seus valores N50, após a montagem, foram de 12.528, 5.769 e 17.553. Estas características indicam bons parâmetros para a continuidade do projeto, em que será realizada a taxonomia das amostras, abundância e diversidade dos taxa in silico e suas correlações com dados relativos a temperatura, umidade e epidemiologia.TCC Identificação e caracterização da comunidade bacteriana do transporte público de Natal/RN através de abordagens metagenômicas e microbiológicas(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2024-08-07) Freitas, João Paulo de Mendonça; Medeiros, Silvia Regina Batistuzzo de; Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção; http://lattes.cnpq.br/3673464953672300; https://orcid.org/0000-0003-2431-0479; http://lattes.cnpq.br/5882662534904226; https://orcid.org/0000-0002-2941-6849; http://lattes.cnpq.br/9302966479649011; Brandão, Deysiane Oliveira; https://orcid.org/0000-0002-9051-1175; http://lattes.cnpq.br/0938468081530870Os ambientes construídos abrigam uma diversidade de microrganismos conhecidos e desconhecidos, que podem ou não ser prejudiciais à saúde humana e animal. Desse modo, o transporte público coletivo constitui um importante ambiente construído que transporta milhares de pessoas todos os dias, sendo um importante meio de transmissão de inúmeros microrganismos. O objetivo deste trabalho foi realizar o primeiro estudo metagenômico no transporte público da cidade de Natal (RN, Brasil) através de sequenciamento de alto rendimento de DNA, obtido através de coletas das superfícies internas da frota de ônibus que transitam entre as quatro zonas da cidade (n = 110), em duas estações climáticas (inverno e verão), e testar o perfil de suscetibilidade antimicrobiana de isolados bacterianos de dois ônibus circulares da UFRN. A taxonomia foi revelada através do GOTTCHA2, uma ferramenta de bioinformática que classifica as leituras metagenômicas comparando-as com bancos de dados públicos. Os resultados do estudo revelou que o microbioma do transporte público de Natal/RN é influenciado majoritariamente pela microbiota de seus usuários, tendo predomínio dos filos Actinobacteria, Proteobacteria e Firmicutes, os quais a maioria dos gêneros estão associados à bactérias da microbiota normal do ser humano. Diversos gêneros bacterianos patogênicos oportunistas foram identificados entre nossas amostras, como Staphylococcus aureus, Enterobacter cloacae, Klebsiella pneumoniae e Haemophilus influenzae, estando rotineiramente associados a diversas infecções, comunitárias e hospitalares. Além disso, a interpretação dos testes de suscetibilidade mostraram que a maioria dos isolados não possuem resistência a antibióticos, mas que algumas bactérias podem possuir genes de resistência, com isolados sugestivos de MRSA e ESBL, que são de grande preocupação mundial. Com isso, conclui-se que mais estudos para perfilamento da comunidade microbiana dos ambientes construídos são urgentes, com a finalidade de identificar e prevenir possíveis surtos infecciosos, além de realizar pesquisas de genes de resistência antimicrobiana nesses espaços.